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裘德科学家杰基·诺里博士和圣
裘德的研究生维多利亚·洪内尔是一个团队的成员,该团队发现了一种超级增强子区域的独特功能,这种增强子在视网膜形成过程中控制基因表达
信用:St
裘德儿童研究医院 增强子是DNA中不编码蛋白质的区域,但控制基因如何表达
超级增强子是一组增强子,它们共同调节在细胞识别中起重要作用的基因
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裘德儿童研究医院研究了Vsx2超级增强剂及其在视网膜发育中的作用
他们的评估显示,超级增强子有四个不同的功能区
这种模块化的超级增强子提供了一种在发育过程中研究基因表达的方法
一篇关于这项工作的论文今天发表在《自然通讯》上
基因表达在发育过程中很重要,因为细胞建立了自己的身份,并成为具有不同功能的各种细胞类型
转录因子Vsx2对眼睛的正常发育至关重要
它在视网膜祖细胞中表达,在已建立的双极神经元和Müller神经胶质中发现
几十年来,研究人员研究了Vsx2,以了解它如何影响发展
基因功能通常是通过敲除(去除)基因并观察其变化来研究的
然而,当Vsx2被击昏时,眼睛不会形成
研究人员无法研究不形成的东西,因此他们需要在视网膜形成的不同时间微调Vsx2表达的能力
相应的作者迈克尔·戴尔博士说:“在大脑发育过程中,重要的转录因子,如Vsx2和许多其他转录因子,通常在不同的时间以精确协调的方式在发育中的大脑的不同部位表达。”
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裘德发育神经生物学系主任兼霍华德·休斯医学研究所研究员
“我们想更好地理解这种复杂的表达舞蹈是如何被控制的,其中一种细胞类型的基因在某个时刻被打开,然后在另一种细胞类型中被关闭,然后在完全不同的区域被激活
" 测试第一个模块化超级增强器 Vsx2的超级增强子控制着视网膜发育过程中复杂而动态的表达模式
“虽然成千上万的超级增强器已经被计算出来,但很少被功能测试过,”第一作者维多利亚·洪内尔说,他是圣
裘德生物医学研究生院
“我们对Vsx2超级增强子的功能测试显示了不同的区域
" 洪内尔说:“我们称之为模块化超级增强器。”
“这种超级增强子的一部分在早期视网膜发育中起作用,然后另一部分对后期发育中的双极细胞发生很重要
" 科学家在Vsx2超级增强子中发现了四个不同的区域
其中三个区域与视网膜发育有关
这是研究人员首次证明了超级增强子中不同区域的独立功能
未来研究的蓝图 与敲除基因等传统基因组方法相比,研究模块化超级增强子可以更清楚地了解基因表达的功能效应
模块化超级增强子允许科学家在特定发育阶段改变特定细胞类型中单个转录因子的表达
因此,模块化超级增强子的概念可以作为研究大脑发育过程中出现的复杂基因表达模式的模型
戴尔说:“当你能够完全理解这些模块化超级增强器中的一个是如何工作的时,你就可以用一个框架去全球化所有的超级增强器,从而更广泛地理解它们。”
“想象一下,你把一个时钟拆开,就能知道哪些部分去了哪里,做了什么
如果你拆开一个完全不同的时钟,你就已经有了一个很好的蓝图,根据第一个时钟,你可以知道哪些部分该放在哪里
" 这项研究的其他作者包括杰基·诺里、阿南德·帕特尔、科迪·拉米雷斯、张家坤、赖玉轩和石彪万
犹大书(圣经新约的一书)
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