图1
RgGH98的计算机分析
(一)SSN对GH98家族的分析
氨基酸序列来自CAZy数据库(www
卡齐
组织)
SSN共分析了355个GH98序列，比对分数为120
每个节点(蓝点)代表一个蛋白质序列
功能特征酶是彩色编码的
(二)RgGH98的域组织，包括N项GBLD(蓝色为52–260 aa)、Cd(红色为274–589 aa)、C项域(绿色为592–876 aa)、C项GBLD(绿松石色为894–986 aa)和C项FN3域(琥珀色为1，099–1，366 aa)
(三)
RgGH98结构示意图
重组rggh 98(44–946 aa)，包含N-术语GBLD(蓝色)、Cd(红色)和C-术语(绿色)结构域；单个N项GBLD域(蓝色)；Cd-C术语域(红绿)；和C术语域(绿色)
使用胞物图v3制作图表
四
0 (A)和IBSv1
0 (ref = https://doi
org/10
1093/生物信息学/btv362) (B和C)
aa，氨基酸；Cd，中央/催化域；C项，C端；C期FN3，C端纤连蛋白3型；C-术语GBLD，C-末端半乳糖结合样结构域；N-术语GBLD，N-末端半乳糖结合样结构域；SSN，序列相似网络
信用:DOI: 10
1371/日志
pbio
3001498 研究人员发现，人类肠道微生物组中的一个普通成员对A血型抗原有特殊偏好
这种特异性可能使它在寻找糖时具有优势，使其更容易在肠道中定居
粘液中A组抗原的存在在肠道的不同部位有所不同，因此这可以确保这些微生物在消化系统的正确部位定居，从而最大限度地提高它们对我们健康的益处
大多数人对血型都很熟悉，血型是由红细胞表面是否存在被称为A和B抗原的分子决定的
自卡尔·兰德斯坦纳首次描述这一系统以来的一个世纪里，很明显，这些“血型”抗原也可以在许多其他身体表面和分泌物中找到
这取决于个人的基因，但大约80%的高加索人有这种“分泌者”的地位
发现血型抗原的地方之一是覆盖消化系统内层的粘液
这种粘稠的物质为肠道微生物群提供了生存环境，也为糖类提供了营养
这个微生物群落对健康和预防疾病和感染至关重要，身体产生粘液作为保护屏障
来自Quadram研究所的Nathalie Juge教授和她的团队一直在研究人体的粘液层如何促进微生物的最佳平衡，以使其定居和繁殖
粘液是由被称为粘蛋白的蛋白质组成的，粘蛋白是一种被糖覆盖的长链
粘蛋白被许多不同的分子“覆盖”，这些分子阻止细菌接近糖，除非它们拥有特定的酶来分解这种覆盖
前情提要，教授
Juge和她的同事发现，这种帽子的特异性意味着只有特定的细菌才能获得粘蛋白糖，这有利于细菌在肠道中的特定位置定居
他们的工作集中在肠道微生物组的重要成员——鼠曲菌上
它们是最早定居在婴儿肠道中的细菌之一，但也存在于90%的成人体内，这使得它们成为研究健康微生物群如何建立的机制的理想选择
有趣的是，R
gnavus还与一系列人类疾病和病症(从炎症性肠病(IBD)到神经疾病)呈正相关或负相关
因此，人们对阐明R
gnavus菌株适应肠道环境
在发表在《公共科学图书馆生物学》杂志上的一项研究中，研究人员确定了鲁米诺球菌菌株可以制造用于分解由血型A抗原制成的粘蛋白帽的酶
该活性对血型A抗原具有高度特异性；进一步的分析表明它不能作用于其他血型抗原
为了了解这种酶对血型A抗原特异性的基础，该团队与来自钻石光源的同事和UEA的核磁共振专家合作，揭示了这种酶与血型A的结构相互作用，并展示了它的形状如何与抗原的形状完美吻合，这对它的活性至关重要
由此，他们可以识别出酶中负责其活性的部分，提供关于其工作原理的详细信息
基因组学分析表明，这种酶的基因是一组基因的一部分，这些基因允许细菌使用粘蛋白作为能量来源，而血型A抗原酶是释放这种潜力的关键
在肠道微生物群中发现的细菌菌株对消化带有A组抗原的粘蛋白具有这种特异性，这为我们理解微生物群是如何建立的又增加了一层
但这是否意味着不同血型的人有着共同的微生物群特征？先前的研究已经关注了这种关联的发生，但结果相互矛盾
这项研究提供了机械证据，表明这些细菌与A血型抗原相互作用，这可能有利于A血型婴儿和成人的定居，但这在人类中的意义仍有待证明
同样，需要对消化系统不同部位粘液中A组抗原的分布进行更详细的研究，以确认这是否是一种鼓励这些细菌在肠道某些部位定居的方式
这项研究中关于作用于血型抗原的酶的知识也可能有助于对抗感染，因为它们被认为是一系列致病微生物的目标
例如，诺如病毒和新型冠状病毒病毒似乎偏爱血型抗原
因此，在这项研究中发现的A血型特异性有可能应用于诊断或治疗
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