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一个
多组学分析战略确定了新冠肺炎急性呼吸窘迫综合征的关键途径和驱动因素
(A)47名危重患者(C)、25名非危重患者(NC)和22名健康对照者(H)被纳入研究
通过密度梯度分离外周血单个核细胞并冷冻，直到用于流式细胞术和全蛋白质组学
血浆用于细胞因子分析和全蛋白质组学
血清用于检测抗ⅰ型干扰素中和抗体、抗新型冠状病毒中和抗体和多靶点抗病毒血清学
全血用于核糖核酸序列和全基因组测序(WGS)
每个组和每个组学的处理样品数量在每个组学名称下方标明
(二)核糖核酸序列管道显示基于数控与数控的比较
为了提高下游分析的稳健性，将具有七种算法的集成智能方法应用于RNA-seq数据的多个分区(参见方法)，以对NC患者和C患者进行分类，对数据的每个分区执行差异分析
然后确定七个算法中的六个算法和所有数据分区的总体排名分数，并将这些基因的前600个用作结构因果建模的输入，以导出假定的因果网络
为了支持第一组患者的关键发现，使用了由81名危重患者和73名康复危重患者组成的第二组患者的RNA-seq数据
数据的划分类似于第一个患者队列，但只有第一个患者队列的前600个特征用于评估基因签名的信息量
(三)细胞因子和免疫细胞定量
WGS数据与来自RNA-seq的基因计数一起用于eQTL分析
对蛋白质组学数据进行差异蛋白质表达和nGOseq富集分析
(四)在第二批81名危重患者和73名康复危重患者中验证了(二)和(三)组学分析得出的关键途径和驱动因素
将主要驱动基因ADAM9的差异表达与公开获得的大量RNA-seq数据进行比较
最后，用新型冠状病毒进行离体感染实验以验证候选驱动基因
信用:DOI: 10
1126/scitranslmed
abj7521 一个国际研究小组分离出五个基因，这些基因在有严重新冠肺炎症状的年轻人中比在没有严重症状的年轻人中更活跃
在他们发表在《科学转化医学》杂志上的论文中，该小组描述了他们对没有已知致病因素的年轻感染者的基因分析
一些健康的年轻人，尽管没有明显的潜在疾病，仍然会出现非常严重的COVID症状
为什么会发生这种情况仍然是个谜
在这项新的研究中，研究人员发现了一个可能的线索——当基因被激活时，似乎会降低身体对抗疾病的能力
这项工作包括从72名年轻的住院COVID患者中收集血浆样本，其中47人病情危重
那些被抽样的人没有任何潜在的条件可以解释他们的症状
研究小组还从22名几乎没有症状或没有症状的受感染年轻人中收集样本作为对照组
研究人员一开始就注意到，那些病情最重的患者还患有炎症和凝血功能增强
然后，他们对样本进行全基因组测序，同时进行RNA测序、细胞蛋白质组学、细胞因子谱和免疫表型分析
他们还使用机器学习应用程序来识别基因模式
他们的分析揭示了五个在症状严重的患者中更活跃的基因
其中，ADAM9被发现是最普遍的
研究小组发现，当ADAM9在体外被阻断在人类肺组织中时，病毒复制自身的效率较低
研究人员建议，他们发现的所有五个基因都需要进行更深入的研究，尤其是ADAM9
这样做可能会导致治疗方法使这些基因失去活性，从而减轻新冠肺炎症的症状
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