物理科技生物学-PHYICA

特殊转录因子高井埃米尔及其靶基因代表了治疗罕见白血病类型的途径

医学研究 2022-02-06 21:51:55

Fig

1:编码BATF3和IL-2R亚单位的基因在H3K27高度乙酰化,并呈正相关

a增强子根据增加的H3K27ac交流信号进行排序

卡帕斯-299 (ALK+)和Mac-1(ALK)ALCL细胞系的SEs内的基因被标记为红色

b H3K27ac ChIP-seq在BATF3位点上的轨迹,带有指示的SE区域

卡帕斯-299和麦克-1细胞系中与SEs相关的基因重叠

d增强子根据增加的H3K27ac信号进行排序

原发性ALCL病患者样本(#54和#208)中SEs内的基因用红色标记

e .通过IPA 2020分析鉴定CRISPR/Cas9介导的BATF3-KO Karpas-299细胞中去调控基因的上游调控子

f .对23名ALCL患者先前发表的RNA-seq数据集中BATF3相关基因的分析(生物项目PRJNA255877,SRA标识符SRP044708)

皮尔逊相关;基于t分布的p值

g在成对的FFPE组织切片中,用ALCL、ALK+的BATF3和IL-2Rα IHC染色法测量的63个患者样本的代表性图像

成熟T-NHL TMAs中IL-2Rα、IL-2Rβ和IL-2Rγ表达的h IHC定量(反应性淋巴结对照,n = 11AITL,n = 8;PTCL-NOS,n = 23ALCL,ALK+,n = 22ALCL、ALK(n = 23)和pcALCL (n = 24)样品

p值由双尾不成对学生测验决定

所有盒须图代表中间值(中心线)、第25-75百分位(盒的边界)和最小-最大值(须)

信用:DOI: 10

1038/s 1467-021-25379-9 间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)是一种白血病,主要发生在儿童和年轻人

一个由梅杜尼·维恩(MedUni Wien)参与的国际研究小组现在已经能够证明转录因子BATF3及其靶基因在肿瘤细胞的生长中起着关键作用

这项研究的发现目前发表在《自然通讯》上,可以作为开发新疗法的一种方法

恶性淋巴瘤是最常见的淋巴癌,如果淋巴细胞分裂不受控制就会发展

霍奇金淋巴瘤(HL)和非霍奇金淋巴瘤之间有所区别,后者还包括不太常见的间变性大细胞淋巴瘤(ALCL),这是一种恶性T细胞淋巴瘤,尤其影响儿童和年轻人

化疗被用作标准疗法,但是复发经常发生

BATF3作为ALCL信号传递的关键转录因子 维也纳医学大学的一组研究人员围绕临床病理学研究所的奥拉夫·默克尔和卢卡斯·肯纳(也在维也纳兽医大学)以及机构合作者,现在已经研究了转录因子BATF3在ALCL病例中的作用

它在ALCL肿瘤细胞中的消除对细胞生长有巨大影响,这表明它是这种疾病中的一种重要蛋白质

研究人员对BATF3的兴趣是受这些发现和BATF3的疾病特异性表达的启发

发现超级增强子区域 除其他外,围绕Stephan Mathas的小组已经能够在早期的合作项目中证明AP-1转录因子家族,其中包括JUNB、cJUN以及BATF3,在ALCL严重表达

鉴于BATF3对该疾病的重要性及其高表达,研究人员假设它可能位于所谓的基因组超级增强子区域

超级增强子是基因组中对基因调控和细胞身份具有重要意义的区域

与波士顿Tom Look实验室一起进行的h3k 27-组蛋白乙酰化的全基因组分析证实,BATF3确实位于所有分析细胞系中的超级增强子区域,而且重要的是还位于原发性ALCL患者样本中

此外,研究人员对BATF3芯片BATF3进行了全基因组结合测试,并确定BATF3与其自身的启动子结合,从而产生正反馈回路

奥拉夫·默克尔解释说:“虽然我们观察到了这些基因,它们的表达被BATF3敲除改变,但IL-2R系统的基因是最显著的,”这促使我们从表达和功能的角度仔细检查了三聚体IL-2受体的成员

" 研究人员确定,ALCL IL-2R复合体的所有三个子单位都被严重激活,IL-2Rα和β是BATF3的直接靶标

“白细胞介素-2是激活T细胞后释放的最重要的白细胞介素,”默克尔解释说,“我们能够证明白细胞介素-2能够促进ALCL肿瘤细胞的生长。”

超过80%的ALCL患者的三种IL-2受体亚单位的高度激活支持了IL-2对ALCL生长具有重要作用的观点,这与功能分析一起表明了IL-2信号在ALCL的高度重要性

“另一种已知与IL-2受体共享两个亚单位的密切相关的细胞因子是IL-15

研究人员也在这里展示了对ALCL细胞的促进生长作用

考虑到可能的治疗方法,研究人员研究了针对白介素-2受体亚单位的武装抗体的效果,该亚单位与针对ALCL细胞的细胞毒素偶联

在动物模型中,即使单次施用这种抗体细胞毒素缀合物也能大量减少ALCL细胞的肿瘤生长,这可能是人体临床试验的基础

本出版物的发现有助于理解间变性大细胞淋巴瘤的发展和生长,并应有助于开发有效的治疗方法

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