双链DNA片段
信用:Vcpmartin/Wikimedia/ CC BY-SA 4
0 希望之城的附属机构转化基因组研究所(TGen)领导的一项全国性研究发现，确定了可能最终用于诊断肝病进展阶段的潜在生物标志物
根据发表在《临床表观遗传学》杂志上的研究，研究人员在多达94%的非酒精性脂肪性肝病患者中发现了DNA甲基化(DNAm)的差异，这种差异可以准确预测肝纤维化的不同阶段，即受损肝脏的瘢痕形成
非酒精性脂肪性肝病是西方国家中最常见的慢性肝病，其特征是脂肪在肝脏中积聚
甲基化是一种生物过程，其中甲基被添加到DNA分子中
这个过程可以改变脱氧核糖核酸的活性，而不会改变组成个体基因蓝图的数十亿个字母的顺序或拼写
“脱氧核糖核酸模式可以用来识别肝脏中不同的细胞类型，以及细胞类型组成的变化，”约翰娜·迪斯特法诺博士说
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，TGen代谢和纤维化疾病项目教授，TGen糖尿病和纤维化疾病部门负责人
她是这项研究的资深作者之一
研究检查了325名患者的数据 研究人员利用活检获得的样本，检查了325名非酒精性脂肪性肝病患者的基因组数据:206名患者没有明显的肝脏疤痕，119名患者有不同程度的纤维化，最严重的纤维化会发展成一种叫做非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的疾病，进而导致肝硬化、肝癌和死亡
研究人员使用脱氧核糖核酸来估计这些样本的细胞组成，发现更严重的纤维化水平与肝脏中免疫细胞百分比的逐渐增加以及上皮细胞百分比的相应减少有关，上皮细胞是一种排列在各种身体表面的细胞，包括肝脏等器官
凯伦·康内利博士
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埃默里大学医学院人类遗传学系副教授、该研究的资深作者解释说，研究人员还发现，即使考虑到个体之间细胞组成的差异，严重纤维化患者基因组特定位点的DNAm水平也会降低
这种差异非常明显，埃默里大学的尼古拉斯·约翰逊博士
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，也是该研究的主要作者，能够开发一个基于28个基因组位点的脱氧核糖核酸的模型，该模型可以在独立的测试集中准确预测94%的非酒精性脂肪性肝病患者的纤维化水平
吴秀梅博士说:“这些发现与脱氧核糖核酸作为细胞组成中纤维化相关变化的基础或标志的机制相一致，并证明了脱氧核糖核酸作为非酒精性脂肪性肝病纤维化的可能生物标志物的潜力。”
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迪斯蒂法诺实验室的TGen工作人员科学家，该研究的作者之一
展望未来的研究 在这项研究中，通过相对侵入性的活组织检查直接从患者肝脏中提取样本
利用TGen首创的技术，他们建议未来的样本可以从循环血液中获得
“循环脱氧核糖核酸被认为是非酒精性脂肪性肝病疾病严重程度的潜在非侵入性生物标志物，”研究说
“这些结果表明，我们的模型有可能预测血液脱氧核糖核酸中的非酒精性脂肪性肝病纤维化
" 未来的分析也可以通过使用单细胞RNA测序来补充，这是一种更精确的基因组信息分析方法，有可能以更高的分辨率测量细胞组成，并有助于更好地理解非酒精性脂肪性肝病纤维化、细胞组成和脱氧核糖核酸之间的关系
“总的来说，我们的研究表明，DNAm提供的信息不仅有助于理解非酒精性脂肪性肝病的潜在生物学，”Dr
迪斯特法诺说，“但也可以作为一种临床工具，能够独立诊断纤维化
" 盖辛格肥胖研究所也参与了这项研究
这项研究——随着非酒精性脂肪性肝病纤维化阶段的进展，差异DNA甲基化和改变细胞类型比例——得到了国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所的资助
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