物理科技生物学-PHYICA

自松野彩夏动计算机程序精确计算细胞中的微核

医学研究 2022-01-22 21:52:20

Credit:Kateryna Kon/Shutterstock 微核是细胞内的小核样结构,通常与肿瘤有关

现在,来自日本筑波的研究人员开发了一种自动计算机程序,可以从显微镜图像中准确、可再现地计数这些结构,这将提高微核研究的速度和准确性

在最近发表的一项研究中,筑波大学的研究人员报告了他们基于MATLAB的新程序,名为CAMDi(计算自动微核区分),该程序从染色细胞的图像中自动计算微核

微核的染色方法与普通细胞核相同,但它们与细胞核的区别在于其体积小得多

然而,识别它们说起来容易做起来难,因为微核自动计数系统传统上只使用从单个组织层面拍摄的图像

为了理解为什么这很重要,想象一下通过一个固定在空间中的球切割一个横截面

如果你在更靠近球体顶部或底部的地方切一个切片,横截面的大小会比你选择更靠近中心的切片小得多——所以靠近细胞核外围的横截面很容易被误认为是微核

为了解决这个问题,筑波大学的研究人员通过细胞或组织拍摄了不同层次的照片,并创建了一个能够分析由此产生的三维信息的程序

通过这种方式,他们确保了程序中所谓的微核实际上是微核

然后,他们用这个程序观察小鼠神经元的微核,并测试神经炎症对微核数量的影响

该研究的相应作者Dr

津田富美

“我们决定测试大脑中的神经炎症是否会影响神经元中的微核数量

" 为了做到这一点,研究人员首先将炎症因子引入培养的小鼠神经元,但是他们使用CAMDi程序没有发现微核数量的变化

然而,当他们给小鼠注射脂多糖时,导致海马区的炎症细胞被激活,海马神经元的微核增加

“这些结果令人惊讶,”博士解释说

鹤田

“他们认为神经元微核的形成是由附近细胞的炎症反应引起的

" 鉴于微核是一系列病理的标志,这种新的计算机程序的开发对于病理诊断和治疗反应的跟踪可能非常重要

为了更好地了解微核的形成及其在疾病中的作用,对微核的研究也将通过使用CAMDi得到加强

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