Fig
1:OSE特异性eRNA基因(CCAT1)中的CTCFBS赋予HCT-116细胞增殖优势
a The境内针对CCAT1的反恐和反恐联邦调查局的位置已标明(黑色箭头)
通过CRISPR编辑，核心结合序列在8个碱基上被修饰，如图中灰色方框所示
橙色方框描绘了增强子区域
b .对OSE境内反恐和反恐融资处占用情况的芯片分析
MYC启动子和H19 ICR被用作阳性对照
底片
CTCF阴性部位(见方法)
c .与HCT-116细胞相比，编辑后的四氯化碳荧光蛋白中的脱氧核糖核酸序列
包含OSE(上)和MYC(下)区域的CTCF结合模式的d-ChIP-seq图谱
根据基因组浏览器快照可视化的ChIP-seq数据，通过对WT HCT-116、D3和E4细胞的三个独立实验进行标准化
代表CCAT1基因区域的方框基序被放大，以识别其内含子内经过编辑的CTCFBS
箭头标识编辑后的CCAT1特定CTCFBS
e .在指定时间点收获野生型和突变型HCT-116细胞的共培养物，随后分别对野生型和突变型CTCFBSs的比例进行qPCR分析
BC21对WT、D3和E4细胞相对生长率的影响
所有基因组坐标都使用hg19作为参考基因组
在所有情况下，数据代表三个独立实验的平均值，并显示标准偏差
p值是通过双尾学生测验计算的
信用:DOI: 10
1038/s 1467-021-27868-3 安妮塔·根德尔的团队发现了癌症基因病理性过度表达的新机制
发表在《自然通讯》上的研究结果表明，癌细胞环境中的信号利用CTCF结合的超级增强子，在涉及非编码核糖核酸的多步骤过程中，将癌基因募集到核孔中
这一发现为靶向过度活跃的癌症基因而不干扰其在正常细胞中的功能提供了新的机会
一种叫做MYC的基因是正常细胞增殖的核心
然而，如果它被过度激活，病理性细胞增殖将随之而来
众所周知，所谓的致癌超增强子具有在肿瘤细胞中维持高水平靶基因表达的能力，包括MYC
该研究小组早些时候已经表明，这种超级增强子能够将活性MYC基因募集到核孔中，并以这种方式增加其表达
然而，这一原理的机械基础以前并不为人所知
目前的研究表明，过度活跃的WNT信号通路，许多癌细胞的一个众所周知的特征，确保致癌超级增强子内的CTCF结合位点调节MYC招募已知对核输出mRNA至关重要的蛋白质因子
此外，在包括激活局部非编码RNA (CCAT1)的逐步过程中，CTCF-超级增强子复合物逐渐将活性MYC基因带到核孔，以促进MYC mRNAs的核输出
由于MYC mRNA在细胞质中比在细胞核中更稳定，整个过程确保了细胞MYC表达总量的几倍增加
通过使用中和WNT信号的药物，研究小组可以阻断整个过程，而不影响正常细胞中MYC的表达水平
“我们的结果为癌症基因的非计划表达机制提供了一个令人惊讶的全新视角
由于这一原则是针对结肠癌细胞的，在正常结肠上皮细胞中并不活跃，因此它可能会通过使用更有针对性的药物来为减少不受控制的癌细胞增殖开辟新的途径，”研究小组的负责人安妮塔·根德尔说，她是卡罗林斯卡学院肿瘤与病理学系的副教授
下一步将是确定针对逐步贩运过程动态的新药物组合
目的是为比放射和化学疗法副作用更小的新药组合铺平道路
安妮塔·根德尔说:“我们研究的优势在于，它发现了驱动病理基因表达的一种众所周知且可靶向的蛋白质的癌症特异性过度表达背后的关键因素，为癌症患者更有效、更特异的治疗提供了新的角度。”
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