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研究发现,全基因组测序将罕见疾病的诊断率提高了近三分之一

医学研究 2022-04-02 21:51:59

Credit: CC0公共域 线粒体疾病影响大约1/4300的人,并导致进行性、不可治愈的疾病

它们是最常见的遗传疾病之一,但临床医生很难诊断,尤其是因为它们会影响许多不同的器官,并类似于许多其他疾病

目前的基因检测系统无法诊断大约40%的患者,这对患者、他们的家庭和他们使用的医疗服务有重大影响

今天在BMJ发表的一项新研究为没有诊断的家庭带来了希望,并支持英国建立基于全基因组测序的国家诊断项目(WGS)的计划,以便更快地做出更多诊断

尽管先前基于小规模、高度精选的队列的研究表明,WGS可以识别线粒体疾病,但这是第一次检查其在国家医疗保健系统——国民健康服务体系——中的有效性

这项研究由剑桥大学MRC线粒体生物学部门和临床神经科学和医学遗传学部门的研究人员领导,涉及319个疑似线粒体疾病的家庭,通过100,000基因组项目招募,该项目旨在将基因组测试嵌入国民健康服务体系,发现新的疾病基因,并为更多患者提供基因诊断

总共有345名参与者——年龄在0到92岁之间,平均年龄为25岁——完成了全基因组测序

通过不同的分析,研究人员发现他们可以对98个家庭(31%)做出明确或可能的遗传诊断

通常更具侵入性的标准测试未能达到这些诊断

做出了六种可能的诊断(98个家庭中的2%)

总共涉及95个不同的基因

令人惊讶的是,62

5%的诊断实际上是非线粒体疾病,有些有特定的治疗方法

之所以会发生这种情况,是因为许多不同的疾病都类似于线粒体疾病,因此很难知道哪些是线粒体疾病

剑桥大学MRC线粒体生物学组和临床神经科学系的Patrick Chinnery教授说: “我们建议全基因组测序应该在早期和侵入性测试如肌肉活检之前进行

病人需要做的就是验血,这意味着这可以在全国范围内以公平的方式提供

人们不需要长途跋涉去多次预约,他们会更快地得到诊断

" 博士;医生

来自MRC线粒体生物学部门以及临床神经科学和医学遗传学部门的凯瑟琳·舍恩说: “明确的基因诊断确实可以帮助患者及其家人,让他们获得关于预后和治疗、遗传咨询和生殖选择(包括植入前基因诊断或产前诊断)的定制信息

" 研究人员做了37个

他们诊断的5%是导致线粒体疾病的基因

这些诊断几乎都是某个特定参与家庭独有的,反映了这些疾病的遗传多样性

线粒体功能受损往往会影响高能量需求的组织,如大脑、周围神经、眼睛、心脏和周围肌肉

这项研究为发现未来的线粒体疾病基因提供了宝贵的新资源

团队的大多数诊断(62

5%)属于具有类似线粒体疾病特征的非线粒体疾病

如果只通过肌肉活检和/或特定的线粒体基因组来调查参与者的线粒体疾病,这些疾病将会被遗漏

这些参与者患有一系列疾病,包括智力残疾的发育障碍、严重的癫痫症状和代谢障碍,以及心脏和神经系统疾病

Chinnery说:“这些患者是因为疑似线粒体疾病而被转诊的,传统的诊断测试是专门针对线粒体疾病的

除非你考虑这些其他的可能性,否则你不会诊断它们

全基因组测序不受这种偏见的限制

" 因此,少数新诊断的参与者已经在接受治疗

该团队在6名线粒体疾病参与者和9名非线粒体疾病参与者中发现了潜在的可治疗疾病,但治疗的影响尚未确定

Chinnery说:“诊断服务在英国分散且分布不均,这给患有罕见疾病的人及其家人带来了重大挑战

通过提供基于这种全基因组方法的国家计划,你可以为每个人提供相同水平的服务

舍恩说:“如果我们能为患有罕见疾病的家庭建立一个全国性的平台,我们就能给他们参与临床试验的机会,这样我们就能获得新疗法有效的明确证据

" 该研究指出,具有可能或可能诊断的患者数量相对较高,这反映出需要加大投资,分析可能是疾病原因的新基因变异的功能影响,但目前还不确定

它还认为,应该为所有疑似线粒体疾病的急性不适个体提供快速三重全基因组测序,这样的结果可以帮助指导临床管理

目前在英国,这仅适用于身体极度不适的儿童

博士;医生

英格兰基因组学公司的临床主任和质量总监埃伦·托马斯说:“我们非常高兴地看到,像这样的重大研究是由10万基因组项目参与者慷慨捐赠的数据促成的

从这些结果中可以清楚地看出,他们对丰富且重要的安全数据集的贡献对于促进基因组研究是至关重要的,基因组研究可以带来类似的见解,从而有可能为国民保健服务体系及其患者带来回报

我们期待看到这些发现如何支持未来对疑似线粒体疾病患者的治疗

"

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