剑桥大学 拉脱维亚中世纪里加的木制厕所
信用:Uldis Kalejs 本周发表在《皇家学会哲学会刊》上的一项新研究表明，首次尝试使用早期细菌检测方法来表征两个中世纪厕所古代肠道内容物的微生物多样性，这是对过去流行病研究的先驱
这些发现提供了对前工业化农业人口的微生物群的洞察，这可能为解释现代微生物群的健康提供了急需的背景
多年来，科学家们注意到，与世界各地的狩猎采集者群体相比，生活在工业化社会的人有着明显不同的微生物群
由此，越来越多的证据将我们微生物群的变化与现代工业化世界的许多疾病联系起来，如炎症性肠病、过敏和肥胖
目前的研究有助于描述肠道微生物群的变化，并强调古代厕所作为生物分子信息来源的价值
剑桥大学的皮尔斯·米切尔通过分析不同寻常的物质，专门研究过去人们的内脏内容
通过在显微镜下观察考古厕所和干燥粪便的内容，他和他的团队了解了大量困扰我们祖先的肠道寄生虫
米切尔评论说:“显微镜分析可以显示肠道内寄生蠕虫的卵，但肠道内的许多微生物太小，根本看不见。”
“如果我们要确定什么构成了现代人的健康微生物群，我们应该开始观察我们祖先的微生物群，他们生活在抗生素使用、快餐和工业化的其他标志之前
" 马克斯·普朗克人类历史科学研究所的古细菌DNA专家、该研究的共同负责人柯尔斯顿·博斯首先对调查长期以来被破坏的厕所内容的可行性表示怀疑
里加中世纪厕所里的显微镜下的鱼绦虫卵
信用:常春藤叶 “一开始，我们不确定肠道内容物的分子特征是否会在厕所中存活数百年
迄今为止，我们在古细菌修复方面的许多成功来自钙化组织，如骨骼和牙结石，它们提供了非常不同的保存条件
然而，“博斯说，”我真的希望这里的数据会改变我的观点
" 研究小组分析了公元14-15世纪耶路撒冷和拉脱维亚里加中世纪厕所的沉积物
第一个挑战是将曾经形成古肠道的细菌与通常在土壤中发现的细菌区分开来，这是研究考古材料不可避免的结果
研究人员发现了各种各样的细菌、古细菌、原生动物、寄生虫、真菌和其他生物，包括许多已知存在于现代人肠道中的分类群
“看来厕所确实是微观和分子信息的宝贵来源，”博斯总结道
苏珊娜·萨宾是MPI-SHH的博士生校友，也是这项研究的共同负责人，她将厕所的DNA与其他来源的DNA进行了比较，包括来自工业和觅食人群的微生物群，以及废水和土壤
“我们发现耶路撒冷和里加的微生物群有一些共同的特征——它们确实显示出与现代狩猎采集微生物群和现代工业微生物群的相似性，但它们之间的差异足以形成它们自己独特的群体
我们不知道有什么现代来源含有我们在这里看到的微生物
" 苏珊娜·萨宾在实验室穿好衣服
信用:赞德拉·法格纳斯 厕所是许多人的粪便混合在一起的地方，厕所的使用让研究人员对整个社区的微生物群有了前所未有的了解
米切尔解释说:“这些厕所给我们提供了比单个粪便样本更多的关于这些地区工业化前人口的代表性信息。”
“结合光学显微镜和古代脱氧核糖核酸分析的证据，我们可以识别生活在几个世纪前的祖先肠道中的各种各样的生物
" 尽管这种新方法有望用于研究微生物群，但挑战依然存在
博斯说:“我们需要在其他考古遗址和时间段进行更多的研究，才能完全理解人类群体中的微生物群是如何随着时间的推移而发生变化的。”
“然而，我们已经迈出了关键的一步，证明从过去的厕所中提取古代肠道内容物的脱氧核糖核酸是可行的
"
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