物理科技生物学-PHYICA

扫一扫二维码下载安装揭示了细胞中关键酶的工作方式

生物 2021-12-19 00:03:41

洛桑联邦理工学院 细胞中的酰化-脱酰化循环

荣誉:吉苏·范德古特(EPFL) s-酰化是通过硫酯键将脂质与蛋白质化学连接的过程

它是细胞的一个重要过程,调节许多蛋白质的定位和功能

它促进蛋白质的脂膜结合,例如与质膜、高尔基体或内核膜结合

像细胞中的大多数生化过程一样,蛋白质S-酰化是可逆的,以调节酰化蛋白质的功能

酰基化被酰基蛋白硫酯酶逆转

为了完成它们的工作,APTs必须与它们的目标蛋白结合的脂质膜相互作用

但是,尽管APTs是重要的酰化脱酰化过程的核心,但是关于APTs如何发挥其功能却知之甚少

由EPFL生命科学学院的吉苏·范·德·古特和马特奥·达尔·佩罗领导的科学家们,已经在理解细胞中主要的酰基硫酯酶APT2的工作原理方面取得了重大进展

这项工作发表在《自然化学生物学》上

首先,研究人员表明,突触传递蛋白具有内在的膜结合能力

结合x光结晶学和分子动力学模拟,他们表明,突触传递蛋白在其结构中包含带正电荷的斑块,使它们能够静电吸引膜的脂质双层

研究小组还发现了一个在突触前体表面的轻度疏水环,他们称之为“β舌”,它允许酶与膜进行疏水相互作用

研究人员合成了具有缺陷β舌的APT2突变体,并发现它们不能结合膜,这使他们得出结论,APT2(和其他延伸的硫酯酶)结合膜的能力是由“舌”序列介导的

APT2的棕榈酰化-脱棕榈酰化循环

荣誉:吉苏·范德古特(EPFL) 通过分析APT2的结构,研究人员还发现了一个可能导致其降解的位点

该位点允许酶与泛素结合,泛素是细胞用来标记分子分解的蛋白质

从本质上来说,APT2包含一个内置的控制机制来控制其自身的降解——但这只能在它的目标被去酰基化并且APT2被释放后发生

或者,在一项工作完成后,APT2可以重新定位到另一个膜,结合它,并在那里脱去另一种蛋白质的酰基

研究人员随后转向APT2本身的硫酰化

先前的研究表明,这种酶在细胞的高尔基体中大量积累,高尔基体是一种细胞器,在将新蛋白质送到细胞膜之前,它会将新蛋白质包装到囊泡中

使用另一个APT2突变体,研究人员能够确定这种积累依赖于APT2本身的S-酰化作用——依赖于沿其序列的半胱氨酸氨基酸(Cys2)

简而言之,Cys-2上的s-酰化对于APT2能够稳定地结合脂质膜并使其在细胞中的靶标脱酰基是必需的

研究小组随后寻找可能的候选酶来酰化APT2

为此,他们筛选了所有棕榈酰转移酶

结果表明,APT2可以被两种棕榈酰转移酶ZDHHC3或ZDHHC7 S-酰化

APT2如何与脂质膜相互作用以脱酰基蛋白质

荣誉:吉苏·范德古特(EPFL) 最后,科学家们将他们的数据汇集在一起,以研究APT2实际上是如何结合脂质膜的,这对其在细胞中发挥功能的能力至关重要

他们发现APT2通过三个步骤结合细胞膜

首先,长距离的静电相互作用通过其正贴片将酶吸引到脂质膜上

在那里,β舌“浸入”细胞膜,将APT2暂时保持在适当的位置,这对于它被酰化它的酶“满足”是必要的

这导致APT2稳定地结合到膜上,并准备执行其脱乙酰功能

“这项研究表明,APT2实际上是一种脂质载体蛋白和水解酶的杂交产物,前者可以从膜中提取脂质,后者可以切割蛋白质中的脂质,”吉苏·范德古特说

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