筑波大学 番茄的两个野生祖先(种属:SLC茄属:番茄变种)
学分:筑波大学 西红柿是世界上最受欢迎的新鲜农产品之一,也是许多人造食品的重要成分
和其他栽培作物一样,一些存在于南美祖先中的潜在有用基因在现代番茄品种番茄的驯化和育种过程中丢失了
番茄
由于其作为一种作物的重要性,番茄基因组序列早在2012年就已经完成并发表,随后有所增加和改进
现在,筑波大学的团队与东京种子公司合作
已经产生了来自秘鲁的番茄的两个野生祖先的高质量基因组序列
陶瓷
他们最近在《基因研究》上发表了这项工作
该团队使用现代的脱氧核糖核酸测序技术,可以读取比以前更长的序列,并结合先进的生物信息学工具来分析生成的数百千兆字节的数据,并确认数据的高质量
他们组装了许多序列片段,展示了在栽培番茄中发现的12条染色体中,哪些序列与已知基因相匹配,还鉴定了数千个现代类型中没有的新基因序列
许多这些新的脱氧核糖核酸序列只存在于一个或另一个祖先物种中
研究人员继续分析了两个祖先番茄中的转录组——这些基因将脱氧核糖核酸转录成核糖核酸信息,为细胞制造蛋白质提供指令——检查了植物的17个不同部分,以显示哪些基因是活跃的
连同与已知基因的比较,这一信息指出了新基因的可能功能,例如在果实发育中,或赋予叶的抗病性,或根的耐盐性
“这些祖传番茄的新基因组序列对于研究这一物种群的进化以及在驯化过程中遗传学是如何变化的将是有价值的,”相应的作者特鲁·有泉教授说
“此外,野生亲缘种含有数千种现代栽培番茄中没有的基因
有了这些新信息,研究人员将能够找到新的有用的基因,这些基因可以培育成番茄,也可能培育成其他作物
这将有助于植物育种者开发出改良的未来番茄品种,具有更好的抗病能力、对气候变化的耐受性以及更好的口感和货架期
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