中国科学院刘佳 信用:CC0公共领域 最近，中国科学院北京基因组研究所的研究人员构建了一个人类长非编码核糖核酸表达数据库
这项研究发表在《核酸研究》杂志上
人类基因组转录了大量的非编码基因，这些非编码基因广泛参与了多种重要的生物过程和人类疾病
尽管已经鉴定出了几十万个人类基因克隆，主要归因于高通量测序技术的快速发展，但其中只有一小部分得到了功能鉴定
由于核糖核酸序列数据为鉴定它们在各种生物条件下的潜在功能提供了最直接的证据，因此希望有一个专门的表达数据库，该数据库能全面整合表达谱并系统地表征人低核苷酸重复序列的表达特征
为此，开发了一个人类基因表达数据库LncExpDB
基于全面的整合和严格的治疗，LncExpDB目前拥有101，293个高质量人类lncRNA基因的表达谱，这些基因来自9个生物环境中337种生物条件的1，977个样本，即
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正常组织/细胞系、癌症组织/细胞系、亚细胞定位、外体、细胞分化、植入前胚胎、器官发育、昼夜节律和病毒感染
LncExpDB估计lncRNA基因的表达可靠性和能力，鉴定25，191个特征基因，进一步获得28，443，865个lncRNA-mRNA相互作用
此外，LncExpDB还配备了用户友好的网络界面，能够跨各种条件交互式可视化表达模式，并在特定环境中轻松探索特色lncRNAs及其交互合作伙伴
该数据库的特点是综合整合和治疗低基因重组蛋白表达谱，因此将作为人类低基因重组蛋白功能研究的基础资源
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