华盛顿州立大学 塔斯马尼亚恶魔
信用:艾莱柯·卡特 在全球新冠肺炎危机中，有一些关于野生动物大流行的好消息——这也可能有助于科学家更好地理解其他新出现的疾病是如何演变的
研究人员发现了强有力的证据，表明一种已经导致塔斯马尼亚魔鬼种群大量死亡的可传播癌症可能不会带来厄运
华盛顿州立大学生物学家安德鲁·斯托尔弗领导的研究小组首次使用系统动力学的基因组工具来追踪袋獾面部肿瘤疾病，这种工具通常用于追踪流感和SARS-CoV-2等病毒
他们首创的方法为其他基因复杂的病原体的应用打开了大门
这项研究发表在12月12日的《科学》杂志上
10，表明恶魔的大流行正在从一种新出现的疾病转变为一种地方病——这意味着疾病传播正在放缓，以至于感染了eac h的恶魔只感染了一种或更少的动物
“这是一个谨慎乐观的好消息，”斯托尔弗说
“我认为我们将会看到比原始种群数量更少、密度更低的恶魔继续存活，但是灭绝似乎真的不太可能，尽管十年前就有人预测过
" 在塔斯马尼亚魔鬼尸体上的战斗
信用:罗德里戈哈马德 自从1996年首次发现袋獾面部肿瘤疾病以来，这种标志性的有袋动物的数量已经减少了80%
当他们打架并互相撕咬对方的脸时，恶魔传播了感染
这种疾病对感染它的塔斯马尼亚魔鬼来说仍然是致命的，但是根据这项研究，它似乎达到了一个平衡，该研究证实了以前实地研究的证据
作者说，这一新证据意味着管理者应该重新考虑将圈养的魔鬼放生到野外的做法
斯托尔弗说:“积极管理可能没有必要，实际上可能是有害的。”
“看起来魔鬼种群正在自然进化，以耐受甚至可能抵抗癌症
通过引入一大群基因幼稚的个体，他们可以与野生个体繁殖，基本上混合基因库，使其不太适应
" 这种疾病——天真的、圈养的个体也可能增加疾病在不同的魔鬼群体中的传播
一个奔跑的塔斯马尼亚魔鬼
信用:艾莱柯·卡特 研究人员依靠实地研究和模型来试图了解塔斯马尼亚魔鬼面部肿瘤疾病的传播，但这是系统动力学首次被成功地用于追踪可传播的癌症
系统动力学采用基因测序来研究病原体谱系之间的进化关系，以了解和预测疾病如何在人群中传播
这种方法已经被用于追踪病毒的传播，包括流感和SARS-CoV-2，它们在基因组中以相对较快的速度积累突变
然而，塔斯马尼亚魔鬼面部肿瘤疾病在基因上比病毒复杂得多
由于这种疾病是一种癌症，来源于动物自身的细胞，需要追踪的基因基本上是袋獾的基因，比典型的病毒病原体的基因多数千个
在这项研究中，研究人员从肿瘤样本中筛选了11000多个基因，以找到以“时钟样”方式变化的基因，显示突变正在快速积累
然后他们鉴定了28个基因，代表超过43万个碱基对，这是脱氧核糖核酸的基本单位
相比之下，导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒的基因组有29000个碱基对
使用这种方法的突破需要几个月的艰苦的计算工作，斯托尔弗将其归功于他的博士生奥斯汀·巴顿，他是WSU大学的一名博士生
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他现在是加州大学伯克利分校的博士后研究员
巴顿说:“这项研究取得的最令人兴奋的进展之一是有机会将这些方法应用于几乎任何病原体。”
“它打开了一扇大门，让我们可以使用在病毒研究中非常重要的方法，来研究一系列影响人类和野生动物的全新病原体
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