赫尔辛基大学 Lazypipe流程图
二进制文件和脚本显示为白色，输入和输出文件显示为绿色
学分:赫尔辛基大学 赫尔辛基大学的研究人员开发了一种新的生物信息学管道，称为Lazypipe，用于识别宿主相关或环境样本中的病毒
这条管道是由病毒学家和生物信息学家密切合作开发的
研究人员认为，他们已经成功解决了病毒宏基因组学中常见的许多挑战
此前，奥利·瓦帕拉蒂教授领导的病毒性人畜共患病研究小组已经发表了两个新的和潜在的人畜共患病病毒因子的例子，这两个因子是从野生动物身上发现的，可以作为载体
一种新的埃博拉病毒是从肯尼亚的莫普斯龙蝙蝠的粪便和器官样本中鉴定出来的，一种新的蜱传病原体——阿龙山病毒是从欧洲东北部的蜱中鉴定出来的
“这些例子证明了Lazypipe数据分析对NGS文库的功效，这些文库具有非常不同的DNA/RNA背景，从哺乳动物组织到混合和压碎的节肢动物，”Dr
Teemu Smura
新冠肺炎提高了快速检测新病毒的需求 当前的冠状病毒大流行增加了以不偏不倚的方式快速检测先前未知病毒的需求
“在没有参考基因组的情况下检测SARS-CoV-2证明了Lazypipe在新的人畜共患病毒病原体出现的情况下的实用性，并且可以通过NGS测序从临床样本中快速检测到，”Dr
康德
4月初，研究小组用Lazypipe测试了SARS-CoV-2阳性样本的文库
“我们证实，在10个带有默认设置的文库中，有9个文库在没有SARS-CoV-2参考基因组的情况下检测到了SARS-CoV-2，”Dr
Ilja Pljusnin
“Lazypipe可以在预测新出现的传染病方面发挥重要作用，”Assoc补充道
教授
Tarja Sironen
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