阿卜杜拉国王科技大学 伊万·维奥拉的团队制作了一个3D模型，展示了SARS-CoV-2的外部(左)和内部结构的最新结构
信用:KAUST伊万·维奥拉 来自电子显微镜图像和蛋白质数据库的信息已被用于开发SARS-CoV-2的详细3D模型，该模型可随着新数据的出现而随时更新
该建模工具有可能可视化其他生物有机体中的成分，大小从10到100纳米不等
“我们的三维模型在原子水平上展示了SARS-CoV-2的当前最先进的结构，并揭示了病毒的细节，这些细节以前是不可能看到的，比如我们认为核衣壳蛋白是如何在里面形成绳状结构的，”考斯特研究科学家ondřej·斯特纳德说
“我们用来开发该模型的方法可以引导生物研究进入新的、有希望的方向，以对抗新冠肺炎病毒的传播，因为它可以帮助科学家迅速将新发现的信息纳入模型，从而提供病毒的最新结构，”他说
该建模系统直观易用
它从生物的少量电子显微镜图像中容易辨别的结构中获取信息
对于SARS-CoV-2，这包括关于病毒膜的形状和大小以及附着在其上的蛋白质结构的信息
然后，科学家可以将现有数据库中关于细胞内其他蛋白质的信息整合到模型中
这包括非典病毒的单链核糖核酸和保护它的核衣壳蛋白的信息
最后，创建了一组规则，定义了每个组件如何定向以及如何与其他组件交互
“该系统使用提供的信息来预测细胞的整体形状，并生成一个3D模型，”斯特纳德解释说
学分:阿卜杜拉国王科技大学 该团队使用他们的方法开发了非典冠状病毒2型的3D图像
“我们的模型显示了迄今为止我们所知的完整的病毒超微结构，而不仅仅是脂质膜上一些任意放置的、不完整的尖峰蛋白，”考斯特计算机科学博士解释说
D
学生Ngan Nguyen
“其他可用的模型也没有显示病毒的内部，因为其细节目前尚不清楚
美国斯克里普斯研究所
S
，为我们提供了基于当前数据的结构内部最可能的假设
如果这个假设被证明是错误的，那么我们可以很容易地更新模型，”她解释说
该团队希望他们的非典-冠状病毒-2模型将有助于揭示病毒及其结构的某些方面，从而加速治疗新冠肺炎的药物发现
他们还希望来自不同生物领域的科学家能够共享信息，并交换与蛋白质构象相关的规则，以便使用建模系统进行研究
需要进一步改进该系统
该团队计划设计一个用户友好的图形用户界面，使其易于使用
他们还希望使其适用于虚拟现实环境
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