中国科学院李源 信用:Pixabay/CC0公共域 基因复制提供遗传原材料,被认为是多样化和进化的重要驱动力
陆生植物的进化以反复发生的祖先古多倍体事件为特征
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祖先全基因组复制
模式植物拟南芥和水稻中的重复基因可以追溯到五轮多倍体
苔藓植物(包括苔藓)在大约5亿年前从其他陆生植物分支而来,是陆生植物(胚胎植物)进化过程中占据重要系统发育位置的关键类群
为了解决藓类植物的精确系统发育和祖先基因组复制事件的系统发育定位,来自中国科学院新疆生态与地理研究所、香港浸会大学、香港中文大学和密苏里大学的研究人员揭示并描述了藓类植物进化中的四次大规模基因复制
这项研究发表在《系统学与进化杂志》上
研究人员利用对近30个苔藓转录组的系统转录分析来探测单拷贝基因家族,并生成可靠的物种系统发育
然后,他们将分析与大规模系统发育分析相结合,研究来自5000多棵基因树的复制信号,以确定祖先基因组复制事件的系统发育定位
结果表明,在系统发育分析中发现了两个具有大量基因重复的分支,一个在所有藓类植物的祖先中,另一个在苔藓植物、毛藓科和四毛藓科分离之前
对在小立碗藓基因组的基因组同基因区保留的重复副相似物的系统发育进展的分析证实了全基因组重复事件WGD1和WGD2分别被重新识别为ψ事件和Funarioideae重复事件
ψ多倍体事件与苔藓动物的早期多样化密切相关,苔藓动物是苔藓动物科、双蛙科、鮈科和鮈科的祖先
总之,四个具有大量基因重复的分支在P
专利
研究人员分析并讨论了不同苔藓谱系中四次大规模复制后的基因保留模式
胁迫相关基因的反复显著保留可能有助于它们适应不同的生态环境,以及这种早期分化的陆生植物谱系的进化成功
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