作者:鲍勃·伊尔卡，物理
（同organic）有机 信用:Unsplash/CC0公共领域 斯坦福大学的一组研究人员与格拉德斯通数据科学和生物技术研究所和阿卜杜勒阿齐兹国王大学的同事合作，开发了一个软件系统，可用于整合单细胞染色质可及性分析
在他们发表在《自然遗传学》杂志上的论文中，该小组描述了该软件、运行该软件的平台以及研究人员如何使用该软件
目前，研究人员能够产生包含单细胞染色质信息的非常大的数据集，单细胞染色质是构成染色体的物质，如脱氧核糖核酸和核糖核酸
不幸的是，用于分析这些数据的工具是有限的
其中一个主要问题是作为这种分析的一部分而产生的额外数据量——其增长速度之快令计算机内存不堪重负
在这项新的努力中，研究人员通过开发一种叫做ArchR的新软件产品克服了这个问题
这种新软件是面向研究基因被脱氧核糖核酸的物理排列所调控的方式
ArchR可以用来分析关于染色质可及性的单细胞数据——它展示了脱氧核糖核酸参与转录的方式
更具体地说，它可以用于分析单细胞聚类、双重去除、细胞轨迹识别和统一峰集生成
使软件更加有用的是，它可以在不需要高性能计算机的情况下运行
该项目的研究人员还声称，它有一个易于使用的界面，用于执行各种分析场景
他们还声称，新软件运行的一些分析模式与其他系统相同，但速度更快
最重要的是，由于它的设计方式，内存问题将不再是一个问题
测试表明，它能够处理比当前系统大得多的数据集
研究人员指出，新系统提供了一种更简单的方法来结合转录组和表观基因组分析
他们认为他们的新软件对该领域的研究人员有实际应用价值
他们接下来计划给系统增加更多的功能
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