物理科技生物学-PHYICA

单细胞测序揭示罕见肾细胞类型的分子小川りの特征

生物 2021-11-15 00:02:32

卡罗林斯卡学院 信用:CC0公共领域 Jaakko Patrakka和他在实验室医学系的研究小组与Rickard Sandberg教授在细胞和分子生物学系的小组一起获得了一份在《自然通讯》上发表的关于单细胞测序的出版物,该出版物揭示了罕见肾细胞类型的分子特征

肾组织是非常异质性的,有超过30种不同的细胞类型

这使得很难定义单个肾细胞类型的分子指纹,因为通过分析整个肾组织获得的表达水平产生了大量细胞的平均数据

为了克服这一挑战,我们在小鼠和人类肾脏组织中开发了单细胞RNA测序方案,特别关注肾脏的超滤单元——肾小球

发表的研究中最重要的结果是什么? 我们在肾小球壁细胞(系膜细胞)中检测到了以前未知的异质性

这非常有趣,因为系膜细胞损伤在大多数慢性肾脏疾病的发展中起着关键作用

我们的研究重写了系膜细胞的定义,并显著更新了我们对这种独特细胞类型的认识

我们研究中的另一个主要发现是,人类肾细胞与相应的小鼠细胞具有非常不同的分子特征

例如,许多与疾病相关的人类细胞特异性基因在小鼠的相同细胞类型中不能表达

这些差异可以解释该领域的许多转化挑战,我们的数据有望指导未来研究中动物模型的选择

你/你的小组和KI:s在研究中的角色是什么? 我们小组全面负责管理这个项目

我们优化并进行单细胞捕获、下游分析、验证实验和功能研究

生物信息学分析是与里卡德·桑德伯格教授在细胞和分子生物学系的团队一起进行的

人类肾活检材料是在卡罗林斯卡大学医院病理科收集的

肾组织的高分辨率成像是与索纳的生命实验室和德国科隆大学合作完成的

现在发生了什么,下一步是什么? 显然,单细胞转录组学可用于研究肾脏病中许多不同的生物学和临床问题

一个悬而未决的问题是关于肾脏保护药物:它们为什么能保护肾功能?目前使用的药物在很大程度上是基于现有疗法的再利用,既不是基于肾脏靶点,也不是为解决潜在的分子机制而设计的

用这些药物治疗的肾脏的单细胞分析可以揭示哪些细胞类型和机制在介导它们的肾脏保护作用

这可以为开发新的、更有针对性的肾脏疗法提供可能性

我们也想应用单细胞分析来研究肾组织的再生

这是一个极具争议的话题,因为我们仍然不知道一些主要的肾细胞类型是否可以再生

我相信对潜在祖细胞群的单细胞分析可以回答这个领域一些重要的悬而未决的问题

来源:由phyica.com整理转载自PH,转载请保留出处和链接!

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