中国科学院刘佳 信用:Pixabay/CC0公共领域 今年是人类基因组测序20周年
为了纪念这一事件,一个由教授领导的研究小组
中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(IVPP)的傅乔妹回顾了古DNA (aDNA)领域的最新进展
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,从过去生物的遗骸中获得的DNA
这篇题为“从古代人类基因组学的第一个十年对人类历史的洞察”的评论发表在9月20日的《科学》杂志上
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古代的脱氧核糖核酸研究始于短的脱氧核糖核酸片段,后来由于高通量测序技术的广泛应用而得到发展
2010年,三份古代基因组草案(I
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、尼安德特人、丹尼索瓦人和一个来自格陵兰岛的4000岁的现代人标志着aDNA研究的新时代
灭绝的远古人类的基因组(I
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尼安德特人和丹尼索瓦人)已经被重建
重要的是,丹尼索瓦人最初是通过仅使用aDNA数据来识别的
这两个古老的血统被证明是在大约55万年前从现代人类中分离出来的
他们随后相互分离了约400 ka
这些aDNA分析表明,在大约550 ka的分离之后,古代和现代人类并没有保持相互隔离
在远古人类之间已经发现了多次的渗透波(即
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尼安德特人和丹尼索瓦人)和现代人类
此外,这两个古老的血统混合在一起,正如一个大约50岁的古老个体(丹尼索瓦11)所显示的那样,他的母亲是尼安德特人,父亲是丹尼索瓦人
至于早期现代人类群体,遗传数据支持起源于非洲
然而,仍然很难确定一个单一的模式来描述非洲祖先的起源
无论如何,在大约250-200千年间的某个时候,促成早期现代人类祖先的五个主要分支开始在非洲短时间内相互分裂
在欧亚大陆,早在约45 ka前就从早期现代人类获得了基因组数据
这些数据揭示了几个早期现代人类谱系
其中一些与后来的种群没有可检测到的遗传连续性,而另一些,包括代表古代北西伯利亚人、古代欧洲人和古代亚洲人的种群,可能与今天的人类种群有遗传联系
随着时间的推移,越来越多的人口结构、更多的人口互动和更多的人口迁移出现在欧亚大陆
“在最后一次冰川最大值时期,也就是LGM,一个27-19ka的严酷时期,在欧洲、东亚和西伯利亚观察到了人口变化
LGM之后,随着气候变暖和更加稳定,人类人口扩张、迁移和互动。”
傅;饲料单位
古代DNA研究有效地拓宽了我们对人类历史的理解
然而,我们只是潜入了水下
需要做出更多努力
这应包括从30 kyr以上的基因组和非洲、亚洲和大洋洲等地区进一步取样;利用蛋白质组学、同位素学、微生物学和表观遗传学等其他古老的分子信息,进一步扩大aDNA的研究范围;并进一步探索适应性变体
除了扩展我们对人类历史的理解,aDNA研究还增强了我们对人类生物学的理解
探索人类如何适应极端环境,如LGM和过去的传染媒介,将有助于我们面对新的挑战,如气候变化和未来更多的流行病
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