物理科技生物学-PHYICA

科学家暖暖下载使用DNA折纸技术来监控CRISPR基因定位

生物 2022-10-14 00:03:25

生物物理学会 信用:CC0公共领域 获得2020年诺贝尔化学奖的这项发现被称为CRISPR/Cas9,这是一把非凡的基因剪刀,有时会在一些并非设计目标的地方剪开

尽管CRISPR通过允许科学家快速编辑基因序列完全改变了基础研究的速度,但它的工作速度如此之快,以至于科学家很难看出有时会出现什么问题,并找出如何改进它。

洪堡大学博士后朱琳·马达里亚加·马科斯和他在德国莱比锡大学拉尔夫·塞德尔教授实验室的同事们发现了一种分析CRISPR酶超快速运动的方法,这将有助于研究人员了解他们如何识别目标序列,以期提高特异性

马达里亚加·马科斯将于2月23日星期二在生物物理学会第65届年会上介绍这项研究

为了使用CRISPR酶来编辑基因序列,科学家可以定制它们,以针对人类基因组30亿个脱氧核糖核酸碱基对中的特定序列。

在目标识别过程中,CRISPR酶解开脱氧核糖核酸链,找到与CRISPR附着的核糖核酸序列互补的序列

但有时核糖核酸与不完全互补的脱氧核糖核酸序列相匹配

为了排除这种意想不到的匹配,科学家需要能够观察CRISPR是如何沿着单个DNA碱基对进行的,但是这个过程很快,很难观察到

为了在超快速的时间尺度上测量CRISPR的行为,马达里亚加·马科斯和他的同事们转向了DNA折纸术,这种方法使用特殊的DNA序列来形成复杂的三维纳米结构,而不是简单的双螺旋。

脱氧核糖核酸折纸在药物输送、纳米电子学甚至艺术方面都有应用

他们使用脱氧核糖核酸折纸术,用脱氧核糖核酸制造旋翼,这样他们就可以用显微镜上的高速摄像机观察CRISPR酶对脱氧核糖核酸的解缠绕,导致旋翼像直升机桨叶一样旋转

有了这个系统,他们能够测量不同的反应匹配和错配的脱氧核糖核酸序列

“当CRISPR/Cascade第一次与DNA相互作用时,我们能够直接测量它的能量景观,”马达里亚加·马科斯说

这项技术将帮助科学家更好地理解CRISPR酶,以及它们最终是如何在比赛中着陆的

这样,他们就可以找出如何优化CRISPR,从而减少目标外匹配

未来,马达里亚加·马科斯有兴趣“开发更多的工具和方法,以新的方式和更详细的水平研究这些基因编辑过程

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