威康信托桑格研究所 信用:CC0公共领域 病毒是地球上数量最多的生物实体
现在，韦尔科姆·桑格研究所和EMBL欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的研究人员已经鉴定出140，000多种生活在人类肠道中的病毒，其中一半以上以前从未见过
这篇论文发表在今天(2021年2月18日)的《细胞》杂志上，包含了对从世界各地收集的28000多个肠道微生物样本的分析
研究人员发现的病毒数量和多样性惊人地高，这些数据为理解肠道病毒如何影响人类健康开辟了新的研究途径
人类的肠道是一个难以置信的生物多样性环境
除了细菌，数十万种被称为噬菌体的病毒也生活在那里，这些病毒可以感染细菌
众所周知，肠道微生物失衡会导致疾病和复杂情况，如炎症性肠病、过敏和肥胖
但是相对来说，我们对肠道细菌以及感染它们的噬菌体在人类健康和疾病中的作用知之甚少
韦尔科姆桑格研究所和EMBL欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的研究人员使用一种称为宏基因组学的DNA测序方法，探索并记录了在28060个公共人类肠道宏基因组和2898个从人类肠道培养的细菌分离基因组中发现的病毒物种的生物多样性
这项分析确定了生活在人类肠道中的140，000多种病毒，其中一半以上以前从未见过
医生
EMBL-EBI和韦尔科姆桑格研究所的博士后亚历山大·阿尔梅达说:“重要的是要记住，不是所有的病毒都是有害的，而是肠道生态系统的一个组成部分
首先，我们发现的大多数病毒都有DNA作为其遗传物质，这与大多数人所知的病原体不同，如SARS-CoV-2或寨卡病毒，它们是RNA病毒
其次，这些样本主要来自没有任何特定疾病的健康个体
看到有多少未知物种生活在我们的肠道中，并试图解开它们与人类健康之间的联系，这是令人着迷的
" 在发现的数万种病毒中，发现了一个新的高度流行的分支——一组被认为有共同祖先的病毒，作者称之为古巴噬菌体
这被发现是人类肠道中第二个最普遍的病毒分支，仅次于2014年发现的厚壳噬菌体
这两种病毒似乎都感染了相似类型的人类肠道细菌，但是如果没有进一步的研究，很难知道新发现的古巴噬菌体的确切功能
医生
路易斯·弗
这项研究的第一作者，来自韦尔科姆桑格研究所的卡马里奥-格雷罗说:“我们工作的一个重要方面是确保重建的病毒基因组具有最高的质量
严格的质量控制管道与机器学习方法相结合，使我们能够减轻污染，获得高度完整的病毒基因组
高质量的病毒基因组为更好地理解病毒在我们肠道微生物群中的作用铺平了道路，包括发现新的治疗方法，如来自噬菌体的抗菌剂
" 这项研究的结果形成了肠道噬菌体数据库的基础，这是一个高度精确的数据库，包含142，809个非冗余噬菌体基因组，对于那些研究噬菌体及其在调节肠道细菌和我们自身健康中的作用的人来说，这将是一个无价的资源
医生
韦尔科姆桑格研究所这项研究的资深作者特雷弗·劳里说:“噬菌体研究目前正在经历一场复兴
这份高质量、大规模的人类肠道病毒目录恰逢其时，可作为未来病毒研究中指导生态和进化分析的蓝图
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