物理科技生物学-PHYICA

研究人员彩虹视频app展示了追踪鲑鱼和鳟鱼遗传多样性的新方法

生物 2022-09-30 00:03:15

俄勒冈州立大学 一条产卵的红带鳟鱼(O

来自上克拉马斯盆地

荣誉:俄勒冈州立大学约翰尼·阿姆斯特朗 俄勒冈州立大学和美国的科学家

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美国林务局已经证明,从俄勒冈州和加利福尼亚州北部河流的水样中提取的脱氧核糖核酸可以用来估计太平洋鲑鱼和鳟鱼的遗传多样性

这一发现刚刚发表在《分子生态学》杂志上,对这些物种的保护和管理具有重要意义,这些物种受到人类活动的威胁,包括那些加剧气候变化的活动

该论文的主要作者、俄勒冈州立大学博士后凯文·韦特米尔说:“西北地区一直缺乏这类数据。”

“这使我们能够同时快速获得多个种群和物种的快照

" 除了证明环境脱氧核糖核酸(eDNA)可以用来测量遗传多样性,研究人员还对这些物种的历史做出了意想不到的发现,包括俄勒冈州北部和南部流域之间的联系

埃德娜允许科学家测试环境中是否存在有机体,比如土壤或水

这是一种安全、快速、经济的方法,可以减少科学家捕捉单个生物体来收集脱氧核糖核酸的需要

俄勒冈州立大学和美国农业部森林服务太平洋西北研究站团队的研究是独一无二的,因为它使用埃德娜样本来确定四种物种的遗传多样性——而不仅仅是存在与否:鲑鱼、奇努克鲑鱼、虹鳟鱼/钢头鳟鱼和沿海割喉鳟鱼

该团队此前开发了一些技术,使其能够在广阔的土地上捕捉这一组健壮的遗传序列

韦特米尔说:“了解任何受关注物种的长期遗传多样性对于保持种群完整性非常重要。”

“我们需要确保它们有足够的多样性来维持这些种群的生存

" 他说,这对鲑科鱼类尤其重要,包括鲑鱼和鳟鱼,因为它们的遗传多样性受到种群数量下降和孵化厂饲养的鲑鱼释放到河流中的影响

在研究人员研究的大部分流域中,钢头鲑、奇努克鲑和科霍鲑经历了大幅下降,这导致它们被列为濒危物种

沿海割喉鳟鱼的数量在一些地方有所下降,但还不足以被列入名单

夏季,乌姆普夸河的主干

信用:洛丽塔艾伦伯格,USFS PNW研究站 在这项研究中,研究人员检查了2017年从俄勒冈州西部和加利福尼亚州西北部16个地点采集的水样

他们在五个流域的一到五条小溪中取样:德舒特、威拉米特、姆普夸、罗格和克拉马斯

他们还从俄勒冈海岸的三条河流中取样

他们发现了北部德舒茨流域和南克拉马斯流域的虹鳟之间的遗传相似性

这被认为是先前假设的两个现在分离的流域之间的水文联系的第一个基因确证

科学家们在鲑鱼中发现了意想不到的高水平的遗传多样性,尽管这种物种只存在于他们取样的三条河流——科基尔河、内斯托卡河和克拉马斯河

他们展示了较小的沿海河流对遗传多样性,特别是沿海割喉鳟鱼的不相称的重要性——他们分析了来自滋养内斯托卡河、阿尔萨斯河和科基尔勒河的小溪的样本

韦特米尔说:“相对于人口数量和流域面积而言,这些河流的多样性超出了它们的重量。”

研究人员还发现了姆普夸流域独特多样性的进一步证据

他们发现了沿海割喉鳟鱼独特的遗传变异,以及在较小程度上虹鳟鱼

乌姆普夸鱼也是两条较小的鱼——乌姆普夸鱼和乌姆普夸鱼——的唯一家园

该论文的作者、俄勒冈州立渔业和野生动物部门的副教授蒂芙尼·加西亚说:“乌姆普夸的多样性使它成为俄勒冈的一个特殊的地方,这篇论文是另一条证实这一点的信息。”

研究人员计划继续这项研究,使用美国农业部水生和河岸有效性和监测项目收集的水样

他们定期从俄勒冈州和加利福尼亚州的200个地点收集水,包括这项研究关注的16个地点

该论文的作者、美国农业部西北太平洋研究站的鱼类生物学家布鲁克·佩纳卢纳(Brooke Penaluna)说:“我们正与他们合作,监测和了解太平洋鲑鱼和鳟鱼以外的各种物种的数量,包括其他鱼类、两栖动物、贻贝、大型无脊椎动物、小龙虾和病原体。”

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