科尔多瓦大学 进行新研究的团队成员
学分:科尔多瓦大学 圆蛤是一种楔蛤,广泛分布于北欧、地中海和西非的海岸和河口
像其他软体动物一样,它被用作生物指示剂来研究这些类型的生态系统中的污染,因为它能够积累重金属和有机污染物
一项新的研究成功鉴定了这种双壳类动物的转录组和相关的蛋白质组,这一发现可能代表着沿海地区污染物早期检测的一个重要飞跃
虽然基因组是包含生命所必需的遗传信息的脱氧核糖核酸内容,但转录组仅包括表达的基因信息,而蛋白质组是在给定时间和特定条件下表达的蛋白质的总和
因此,它的重建是理解污染的分子效应的关键
由于这一发现,这项研究成功地鉴定了与总共174种生物过程相关的蛋白质
其中包括与这些生物遭受污染及其影响时所遭受的应激反应机制相关的各种分子功能
这项工作始于与安达卢西亚海洋科学研究所、科尔多瓦大学的“应激反应机制的分子生物学”和该大学机构的中央研究支助处(SCAI)的合作,后者负责生物信息学部分,这是转录组重建的关键
研究人员卡门·迈克尔解释说,在受控条件下从这种软体动物中分离出核糖核酸样本后,提取了小的遗传序列
这项研究成功地将三种数学算法结合起来,对所有这些小片段进行排序,重建整个基因,并把这个伟大的生物难题的所有部分集合在一起
该软件工具为生物分子分析提供了一个坚实的数据库,并构成了指导未来工作的灯塔
此外,另一位参与该研究的研究人员何塞·阿尔哈马教授表示,“拥有这一工具增加了新研究成功的可能性,不仅在对这一特定双壳类的研究中,而且在其他类似的软体动物中也是如此
“研究人员解释说,没有对这种类型的生物进行过类似的研究
现在,这张参考地图有助于更好地评估污染对海洋生态系统的影响,以免造成不可挽回的损害
来源:由phyica.com整理转载自PH,转载请保留出处和链接!