新加坡-麻省理工学院研究和技术联盟 斯马特博士后伊琳娜·阿弗尼娜博士和NTU博士生杰罗姆·蔡使用克里斯普里技术来了解粪肠球菌生物膜的形成
学分:新加坡-麻省理工学院研究和技术联盟 新加坡-麻省理工学院研究与技术联盟(SMART)、麻省理工学院在新加坡的研究机构和南洋理工大学(NTU)的抗微生物耐药性(AMR)跨学科研究小组(IRG)的研究人员开发了一种使用CRISPRi技术的工具，该工具可以帮助理解和预防生物膜的形成、耐药性和其他细菌(如粪肠球菌)的生理行为
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粪肠球菌是一种在人体肠道中发现的细菌，是医院相关感染的最常见原因之一，可导致多种耐多药、威胁生命的感染，包括菌血症(血流感染)、心内膜炎(心脏感染)、导管相关尿路感染和伤口感染
然而，目前理解和预防E
粪肠球菌生物膜的形成和发展是劳动密集型和耗时的
SMART AMR研究小组设计了一种易于修改的遗传技术，可以快速有效地沉默细菌基因以防止感染。
在一篇名为“多重CRISPRi系统能够研究粪肠球菌阶段特异性生物膜遗传需求”的论文中，研究人员解释了可扩展的双载体nisin诱导的CRISPRi系统，该系统可以识别允许细菌如大肠杆菌生长的基因
粪肠球菌形成生物膜，引起感染，获得抗生素抗性，并逃避宿主免疫系统
该团队将CRISPRi技术与可控启动子下的快速DNA组装相结合，能够快速沉默单个或多个基因，以研究肠球菌生物学的几乎任何方面
“由大肠杆菌引起的感染
粪肠球菌通常对抗生素有耐受性，并且更难治疗，这使得它们成为重大的公共健康威胁
Irina Afonina，SMART AMR博士后助理，该论文的主要作者
“识别参与这些细菌过程的基因可以帮助我们发现新的药物靶点或提出抗菌策略，以有效治疗此类感染并克服耐药性
" 该团队相信，他们的新工具将有助于快速有效地研究肠球菌生物学和病原疾病、宿主-细菌相互作用和种间交流的广泛方面
该方法可以扩大规模，同时沉默多个细菌基因或进行全基因组研究
“细菌生物膜是包裹在自我生成的保护性基质中的细菌群，”SMART AMR首席研究员、NTU副教授金伯利·克莱恩说，他也是该论文的相应作者
“我们设计的系统使我们能够容易地询问大肠杆菌生物膜发育周期中的各个阶段
粪肠球菌
通过选择性沉默预先形成的成熟生物膜中的某些基因，我们可以侵蚀生物膜并迫使其扩散
" 可扩展的CRISPRi系统使用高通量筛选，可以快速鉴定基因组合，同时作为新的和有效的抗微生物组合疗法的靶点
SMART的诱导型CRISPRi系统背后的想法是由Kline教授和SMART AMR首席研究员Timothy Lu教授提出的
阿弗尼娜开发并交付了基因工具
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