格拉斯哥大学艾玛·汤姆森 彩色扫描电子显微照片显示，一个垂死的细胞(蓝色)严重感染了导致新冠肺炎的SARS-CoV-2病毒(黄色)
信用:马里兰州德特里克堡国家信息与发展研究所综合研究机构
早在2020年2月，科学家们对来自苏格兰第一批新冠肺炎确诊病例(以及第一波病例)的病毒样本进行测序，发现了社区传播的证据，这是由通过国际旅行进行的多次引进所推动的
在由格拉斯哥大学领导并发表在《自然微生物学》上的一项新研究中，研究人员已经能够证实，导致新冠肺炎的SARS-CoV-2病毒在2020年初曾多次被引入苏格兰，主要来自意大利和西班牙等欧洲国家
通过观察SARS-CoV-2的全基因组序列，研究人员发现，在苏格兰爆发的前四周，该病毒被引入了数百次，主要来自其他欧洲国家
经证实，与旅行相关的非典冠状病毒2型进入苏格兰的时间早于英国的旅行限制和其他欧洲国家的广泛限制
尽管去mainland China的旅行限制在一月底开始实施，研究显示，与东南亚直接相关的病例在苏格兰很少
新冠肺炎于3月1日在苏格兰被首次确诊
在疫情爆发的第一个月，2641例新冠肺炎病例导致1832家医院46人入院，207人重症监护入院，126人死亡
然而，由于在疫情爆发的早期阶段尚未引入大规模检测，总体病例的真实数量肯定更高
研究人员发现，许多病毒的引入与报道的旅行无关
这些早期引入的SARS-CoV-2未被发现，并很快在苏格兰建立了不受控制的社区传播
在苏格兰分析的SARS-CoV-2样本包括一系列病毒变异体，包括D614G，一种与传染性增加相关的变异体
该研究还显示，在苏格兰疫情爆发的第一个月内，年轻人与旅行相关的感染也明显转变为老年人和医护人员的社区传播
这项研究调查了三月份苏格兰出现的病毒
研究人员使用下一代测序技术从1314名个体中获得了完整的基因组序列，占该疾病所有确诊病例的20%
资深作者艾玛·汤姆森是格拉斯哥大学病毒研究中心的传染病教授，她说:“我们的研究证实，SARS-CoV-2通过至少283种不同的与旅行相关的介绍进入苏格兰人群，导致了多个持续的社区传播群
早在第一次检测到感染后三天，我们就发现了与传播无关的病毒谱系，这表明在第一次检测到病例之前，该病毒谱系就已传入苏格兰并在社区中传播
" “欧洲大陆作为全球冠状病毒大流行中心的出现是苏格兰疫情爆发的一个明显驱动因素，在这项研究中检测到的大多数谱系都与欧洲序列有关
与中国和东南亚其他国家有联系的病例相对而言没有被发现
" “在主要来自其他欧洲国家的多次引进之后，这种病毒在苏格兰和整个英国的传播速度极快
意大利等病例负担重的国家可能会提前实施封锁，其他措施，如对来自高风险地区的旅行者进行隔离，可能会防止疫情升级和正在进行的多群社区传播
" “使用测序和基因组流行病学分析跟踪新型冠状病毒将有助于实时告知我们当前的应对措施和公共卫生干预措施的效果，并且是一种可用于了解未来此类传染病爆发的工具
" 病原体的基因组测序已成为应对病毒爆发的流行病学的核心组成部分，例如刚果民主共和国的埃博拉病毒或中南美洲的兹卡病毒
在这项研究中，一直在乌干达使用该技术的格拉斯哥大学病毒研究中心的研究人员转而对苏格兰的SARS-C oV-2病毒进行测序，同时进行测序的还有苏格兰西部专业病毒学中心的NHS合作伙伴、爱丁堡皇家医院和爱丁堡大学的研究人员
由此产生的数据让科学家们对这种疾病的起源和传播有了更深入的了解，通过分析新冠肺炎在苏格兰的引入，关于这种病毒的范围和传播的信息可以有助于为有针对性的公共卫生干预措施提供信息
汤姆森教授补充道:“随着苏格兰病例数量的持续上升，我们的序列数据为持续感染的实时测序提供了一个基线，可以作为决策者衡量当前措施(包括疫苗接种)成功与否的一个指标，并有助于缓解或收紧公共卫生措施
" 医生
爱丁堡大学临床科学家顾问凯特·邓普顿说:“这种测序方法的引入是格拉斯哥大学、爱丁堡大学和苏格兰公共卫生部门之间的一次伟大合作
这项研究在格拉斯哥和爱丁堡的工作只有通过与大学和英国国家医疗服务系统的科学家合作才有可能
正在进行的工作依赖于苏格兰全国医疗服务体系临床和诊断实验室工作人员的贡献
他们的努力帮助我们建立了一个关于该病毒引入和持续传播的真正的国家图景，并将提供重要信息来指导决策者如何应对这一流行病
" 这项名为“基因组流行病学揭示了从3个欧洲大陆到苏格兰的SARS-CoV-2的多重引入”的研究发表在《自然微生物学》上
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