中国科学院李源 基于加扰的基因组压缩(SGC)方法示意图
信用:SIAT 中国科学院深圳高级技术研究所(SIAT)的研究人员开发了一种称为基于加扰的基因组压缩(SGC)的方法来改造和最小化酵母基因组
他们表明，通过这种方法可以有效地减少合成染色体臂
他们的研究发表在1月4日的《基因组生物学》上
冗余是基因组的一个共同特征，大概是为了确保在不同的和不断变化的条件下健壮的生长
基因组压缩去除了给定条件下不必要的序列
由loxP介导的进化系统进行的合成染色体重排和修饰是植入合成酵母基因组(Sc2)的独特特征
0)，这已被提出作为基因组最小化的有效工具
作为Sc2
0项目即将完成，研究人员已经开始探索加扰系统在基因组压缩中的应用
该研究的第一作者、来自SIAT的副教授罗·周青说:“对于SGC病毒，我们发现的所有毒株都含有一条减少的合成染色体。”
“如果两者之间没有loxP位点，SGC就不能直接去除位于必需基因附近的非必需基因
" 研究人员构建了一个附加的必需基因阵列，并在激活扰频之前将其引入，这增强了SGC的删除能力，不仅通过删除位于必需基因附近的非必需基因，还通过在单个SGC过程中删除更多的染色体序列
通过迭代SGC实现了进一步的压缩，揭示了在富含蔗糖的培养基中，65个非必需基因中至少有39个可以被共同去除，而不影响细胞在30℃的生存能力
“我们在eArray的帮助下开发了迭代SGC，作为压缩合成酵母基因组的通用而有效的工具，”Dr
来自SIAT的戴俊彪，该研究的合著者
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