夸达姆研究所 信用:Unsplash/CC0公共领域 研究人员正在发现成千上万种新的细菌物种，它们和我们生活在一起，在我们身上，甚至在我们体内
我们与它们的关系影响着我们的健康和地球的健康——但是要定义这种关系，新物种需要新的名字
Quadram研究所的科学家开发了一个基于传统林奈系统的自动系统，用于生成格式良好的名称，为新发现的细菌和我们尚未发现的细菌提供了超过一百万个名称
从高层大气到深层地下，细菌几乎在地球上的每一个环境中都存在
对地球上细菌种类的估计各不相同——从数百万到数十亿
我们知道，仅我们人类就在我们的肠道中携带数千种细菌
在18世纪，瑞典博物学家林奈提出了一个给生物命名的系统，其中每个物种都有一个两个字的拉丁名
因此，我们有人类的名字智人，以及大约一百万个其他类似的动植物的名字
还有一些常见的细菌物种的两个词的拉丁名称，如大肠杆菌(通常缩写为E
大肠杆菌)，这是以它的发现者德国微生物学家西奥多·埃舍尔奇的名字命名的，也是以这种微生物所在的结肠命名的
但是，尽管有数百万种细菌，到目前为止只有大约20，000种被赋予了拉丁名
缺乏新名称的一个原因是，大量新物种是通过DNA分析发现的，而不是在实验室中生长的，这与当前细菌物种命名的规则不一致，同时也造成了大量的工作
另外的问题是，大多数细菌学家没有足够的关于拉丁语和希腊语等古典语言的知识来想出格式良好的名字，甚至专家也很难足够快地想出新名字来应对大量的发现
马克·帕伦教授在诺里奇研究公园的夸达姆研究所工作，他想出了一个解决问题的办法，使用一种自动方法将一小组拉丁和希腊词根组合起来，创造出超过一百万个新名字
这个过程的输入文件已经由以色列希伯来大学的细菌命名专家阿哈龙·柳文欢教授仔细检查过了
安德里亚·泰拉廷已经编写了一个计算机程序来自动化这个过程
马克·帕伦教授说:“我们已经展示了希腊和拉丁词根的组合使用是如何被用来为细菌创造超过一百万个完善的分类名称的
这可能代表了科学史上最大的姓名创造
我们希望我们的方法可以扩展到涵盖整个生命之树对格式良好的名字的需求
" 帕伦和他的同事们热衷于指出他们实际上没有命名任何细菌物种
相反，他们已经创建了一个语法正确的名字的数字仓库，可以根据细菌学家同事的需要随时使用
在他们的方法中包括与特定动物或特定系统相关的细菌的名称——例如，一个类似马科单胞菌的名称可以应用于从马分离出的新细菌，而肠道细菌可以应用于从肠道分离出的新细菌
它们还包括一系列纪念科学家同伴的名字，例如以英国博物学家查尔斯·达尔文命名的达尔文主义
生物信息学专家安德里亚·泰拉廷说:“这只是一个过程的开始
我们预测，有一天，给细菌命名就像在谷歌上搜索一样简单
我们所有的计算机代码都可供任何人使用
" 命名专家阿哈龙·柳文欢说:“我们以我最喜欢的罗尔德·达尔短篇小说之一为名，为我们的节目选择了伟大的自动命名器
这是甘的缩写，在希伯来语中是“花园”的意思，说明了我们方法的丰富多彩
看到细菌命名法加入大数据世界是令人激动的
"
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