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历史偏见忽略了与新冠肺炎相关的基朱洪达因

生物 2022-03-14 00:03:06

西北大学 信用:CC0公共领域 基于全基因组实验,人体有2064个与新冠肺炎相关的基因

那么为什么研究人员只研究其中的611个呢? 根据西北大学的最新研究,一种历史偏见——长期以来决定了研究哪些人类基因——现在正在影响生物医学研究人员研究新冠肺炎的方式

虽然生物医学研究人员知道许多被忽视的人类基因在新冠肺炎发挥了作用,但他们目前并没有研究它们

取而代之的是,研究新冠肺炎的研究人员继续关注已经被大量研究的独立于冠状病毒的人类基因

“出于可以理解的原因,研究人员倾向于利用现有的知识和研究工具

共同领导这项研究的西北大学的托马斯·斯托格说:“他们似乎是根据实验的难易程度而不是基因与疾病的最终相关性来选择基因进行研究的。”

“这意味着对新冠肺炎的研究只集中在与病毒反应有关的人类基因的一小部分上

因此,人类细胞对新冠肺炎反应的许多方面仍不清楚

" “有许多基因与新冠肺炎有关,但我们不知道它们在新冠肺炎的背景下做什么,”西北大学的路易斯·阿马拉尔补充道,他与斯托格共同领导了这项研究

“在大流行之前,我们没有研究过这些基因,新冠肺炎似乎也没有激励我们去研究它们

" 这项研究将于11月16日发表

24在eLife杂志上

斯托格是NICO西北复杂系统研究所和遗传医学中心的数据科学学者

通过美国国家衰老研究所颁发的“通向独立之路”奖,斯托格开始建立一个研究实验室,致力于发现对衰老和与年龄相关的疾病有重要贡献的未经研究的基因

阿玛拉尔是伊拉斯特斯·奥

西北大学麦考密克工程学院化学和生物工程教授

斯托格和阿马拉尔都是肺炎治疗成功临床反应系统生物学中心的成员

指出历史偏见 这项研究建立在斯托格和阿马拉尔2018年的研究基础上,该研究首次解释了为什么一些人类基因比其他基因更受欢迎

在这项工作中,他们发现30%的基因从未被研究过,不到20%的基因是90%以上发表论文的主题

尽管研究和表征基因的新技术越来越多,但研究人员仍在继续研究自20世纪80年代以来科学家们一直在研究的一小组基因

历史上,这些基因更容易通过实验来研究

例如,如果一个动物模型具有与人类相似的基因,研究人员更有可能研究该基因

西北大学团队还发现博士后和博士

D

专注于特征不明显的基因的学生成为独立研究者的机会减少了50%

尽管2003年完成的人类基因组计划——所有人类基因的鉴定和绘图——旨在将科学研究的范围扩大到这一小部分基因之外,但它尚未实现这一目标

“研究完全相同的人类基因的偏见非常高,”阿马拉尔说

“整个系统都在与机构和科学知识的目的作斗争,目的是拓宽我们学习和理解的东西

我们需要共同努力,激励对人类健康重要的其他基因的研究

" 偏见持续到COVID时代 在这项新的研究中,斯托格和阿马拉尔求助于由国家医学图书馆策划的《李特科维德》,这是一本与新冠肺炎有关的研究出版物的合集

LitCOVID标记在单个出版物的标题、摘要或结果部分提到的基因

西北大学的研究人员分析了10,395篇已发表的论文和预印本

然后,他们将它们与100多个不同的生物学和文献计量学数据库整合到一个定制数据库中,努力调查和测量生物医学研究的所有方面

最后,他们将新冠肺炎论文中提到的基因与四项全基因组研究确定的新冠肺炎相关基因进行了比较

斯托格和阿马拉尔还跟踪了新冠肺炎文献中出现的基因随时间的变化

令人惊讶的是,他们观察到,自大流行爆发以来,对新冠肺炎基因的研究并没有变得更加广泛,而是变得不那么广泛

该团队希望其研究能激励其他研究人员意识到过去的偏见,并探索未经研究的基因

“我们的发现对科学决策者的长期规划有直接影响,”斯托格说

“我们可以让研究人员关注人类基因,这些基因对于细胞对病毒的反应很重要,但由于历史上获得的偏见,这些基因有被忽视的风险,而这些偏见在文化上得到强化

"

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