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最大的哺乳动物基因组揭蓝宇电影在线示了濒临灭绝的物种

生物 2022-02-17 00:04:18

麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所 由乌普萨拉大学、麻省理工学院和哈佛大学的布罗德研究所的科学家领导的一个大型国际财团已经对130名男性的基因组进行了测序,并分析了这些数据以及110个现有的基因组,以使科学家能够确定哪些是基因中的重要位置

这些新信息可以帮助研究人类的疾病突变以及如何最好地保护濒危物种

这项研究发表在《自然》杂志上

信用:苏珊娜·汉密尔顿 一个名为“动物经济学项目”的国际研究小组分析和比较了80%以上哺乳动物家族的全部基因组,这些家族跨越了近1.1亿年的进化

今天发表在《自然》杂志上的基因组数据集包括了120多个以前没有测序的物种的基因组,并以前所未有的规模捕捉了哺乳动物的多样性

该数据集旨在推进人类健康研究

研究人员可以利用这些数据来比较人类和其他哺乳动物的基因组,这有助于识别可能与人类疾病有关的基因组区域

作者还通过动物园项目网站向科学界提供数据集,对使用没有任何限制

“该项目的核心思想是开发和使用这些数据来帮助人类遗传学家找出哪些突变会导致疾病,”合著者之一、布罗德脊椎动物基因组学科学主管、乌普萨拉大学比较基因组学教授克斯廷·林德布莱德-托赫说

然而,在分析新的基因组时,作者还发现灭绝率高的哺乳动物物种的遗传多样性较少

研究结果表明,即使只对单个个体进行测序,也能以经济高效的方式提供重要信息,说明哪些种群可能面临更高的灭绝风险,并应将其作为深入评估保护需求的优先事项

“我们写这篇论文是为了谈论这个庞大而独特的数据集,并解释它为什么有趣

“一旦你让数据广泛可用,并向更广泛的研究团体解释其效用,你就能真正改变科学的方式,”合著者、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所脊椎动物基因组学小组主任、麻省大学医学院教授埃莉诺·卡尔松说

在最近的一项研究中,动物经济学的数据已经帮助研究人员评估了许多物种感染非典病毒的风险

研究人员确定了47种哺乳动物,它们很有可能是SARS-CoV-2病毒的宿主或中间宿主

绘制哺乳动物地图 动物经济学项目,以前被称为200哺乳动物项目,建立在以前的项目29哺乳动物项目的基础上,该项目于2006年开始对哺乳动物基因组测序

最新的项目通过探索能够完成人类无法完成的生理壮举的物种的基因组来扩展这项工作,从冬眠的松鼠到寿命特别长的蝙蝠

该项目还包括濒危物种的基因组

在这项新的研究中,研究人员与全球28个不同的机构合作,收集样本进行基因组分析,圣地亚哥全球动物园的冷冻动物园提供了几乎一半的样本

该团队专注于具有医学、生物学和生物多样性保护价值的物种,并将具有代表性基因组的哺乳动物家族的百分比从49%增加到82%

该项目还开发并共享工具,使研究人员能够查看哺乳动物基因组序列中的每个“字母”或碱基,并将其与人类基因组中相同位置的序列进行比较,包括可能与疾病相关的区域

这可能有助于研究人员识别在进化过程中保持不变和功能不变的基因位点以及随机突变的基因位点

如果一个位点在哺乳动物中保持稳定数百万年,它可能有重要的功能,所以该位点的任何变化都可能与疾病有关

在发布数据时,作者呼吁科学界支持实地研究人员收集样本,增加对计算资源的访问,从而能够分析大量基因组数据集,并快速公开地共享基因组数据

“动物经济学项目最令人兴奋的事情之一是,我们的许多核心问题对科学界内外的人来说都是可以理解的,”第一作者黛安·杰纳勒说,她是布罗德脊椎动物基因组学集团的研究科学家

“通过设计对所有人开放的科学项目,我们可以确保公众、人类和环境健康的利益

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