美国自然历史博物馆 信用:Pixabay/CC0公共域 研究人员在导致新冠肺炎的非典病毒中发现了一种新的“隐藏”基因，这可能导致了它独特的生物学和大流行的可能性
在一种总共只有大约15个基因的病毒中，对这个和其他重叠基因——或“基因中的基因”——的更多了解可能会对我们如何对抗病毒产生重大影响
这种新基因今天发表在《生命》杂志上
“重叠基因可能是冠状病毒进化成高效复制、阻碍宿主免疫或自我传播的方式之一，”主要作者蔡斯·尼尔森说，他是台湾中央研究院的博士后研究员，也是美国自然历史博物馆的客座科学家
“了解重叠基因的存在及其功能可能会揭示控制冠状病毒的新途径，例如通过抗病毒药物
" 研究小组发现了ORF3d，这是SARS-CoV-2中一种新的重叠基因，有可能编码一种比预期更长的蛋白质。
他们发现这种基因也存在于以前发现的穿山甲冠状病毒中，这可能反映了在SARS-CoV-2和相关病毒的进化过程中这种基因的反复丢失或获得
此外，ORF3d已被独立鉴定，并显示在新冠肺炎患者中引起强烈的抗体反应，证明新基因的蛋白质是在人类感染过程中制造的
“我们还不知道它的功能或是否有临床意义，”尼尔森说
“但我们预测，与抗体反应相比，这种基因相对不太可能被T细胞反应检测到
也许这与基因是如何产生的有关
" 乍一看，基因看起来像是书面语言，因为它们是由传递信息的字符串(在核糖核酸病毒中，是核苷酸A、U、G和C)组成的。
尽管语言(单词)的单位是离散的、不重叠的，但基因可以是重叠的、多功能的，根据你从哪里开始“阅读”，信息可以被加密编码
“重叠的基因很难被发现，大多数科学计算机程序都不是为了发现它们而设计的
然而，它们在病毒中很常见
这部分是因为核糖核酸病毒的突变率很高，所以它们倾向于保持较低的基因数量，以防止大量突变
结果，病毒进化出了一种数据压缩系统，其基因组中的一个字母可以构成两个甚至三个不同的基因
尼尔森说:“缺失重叠基因使我们处于忽视病毒生物学重要方面的危险之中。”
“就基因组大小而言，SARS-CoV-2及其相关病毒是现存最长的RNA病毒之一
因此，它们可能比其他核糖核酸病毒更容易受到“基因组欺骗”
" 在大流行之前，尼尔森在博物馆工作时是生物信息学和计算生物学的格斯特纳学者，他开发了一个计算机程序，可以筛选基因组中重叠基因特有的遗传变化模式
在这项研究中，尼尔森与来自慕尼黑技术大学和加州大学伯克利分校等机构的同事合作，将该软件和其他方法应用于SARS-CoV-2的大量新序列数据中
该小组希望其他科学家将调查他们在实验室中发现的基因，以确定其功能，并可能确定它在大流行病毒的出现中可能发挥的作用
来源：由phyica.com整理转载自PH，转载请保留出处和链接！
