鲁尔大学波鸿分校 信用:CC0公共领域 例如，被病毒感染或携带致癌突变的细胞会产生对身体来说是外来的蛋白质
细胞内这些外源蛋白降解产生的抗原性肽被肽装载复合物装载到所谓的主要组织相容性复合物分子(简称MHC)上，并呈现在细胞表面
在那里，它们被T-杀伤细胞特异性识别，最终导致被感染细胞的清除
这就是我们的免疫系统抵御病原体的方式
机器以原子精度运转 肽装载复合物确保MHC分子正确装载抗原
“肽装载复合物是一种生物纳米机器，必须以原子精度工作，以有效保护我们免受致病病原体的侵害，”皇家生物研究院理论化学中心分子模拟研究小组组长拉尔斯·谢弗教授说
在以前的研究中，其他团队成功地使用冷冻电子显微镜确定了肽负载复合物的结构，但分辨率仅为0
6比1
0纳米，I
e
不是原子细节
基于这些实验数据，谢弗的研究小组与福尔松赞特勒姆·尤里奇的贡纳·施罗德教授合作，现在已经成功地创建了肽装载复合体的原子结构
探索结构和动力学 “实验结构令人印象深刻
但只有通过基于计算机的方法，我们才能提取出实验数据中包含的最大信息量，”施罗德解释道
原子模型使研究人员能够对肽负载复合物进行详细的分子动力学计算机模拟，从而不仅研究结构，还研究生物纳米机器的动力学
因为模拟的系统非常大
慕尼黑莱布尼茨超级计算中心的计算时间大大有助于这项任务
“使用高性能计算机，我们能够在模拟中推进微秒级时间
这揭示了结合到蛋白质上的糖基团在肽装载机制中的作用，这在以前只是不完全被理解
奥利维尔·费塞特，分子模拟研究小组博士后研究员
对免疫过程的直接干预 肽负载复合物的原子模型现在有利于进一步的研究
例如，一些病毒试图通过选择性地关闭装载肽复合物的某些元素来欺骗我们的免疫系统
“我们想要追求的一个可行的目标是对这些过程进行有针对性的干预，”舍弗总结道
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