美国化学学会 信用:美国化学学会 全世界的科学家都在争先恐后地寻找SARS-CoV-2的抑制剂,这是新冠肺炎大流行背后的新型冠状病毒
一些人在实验室进行实际实验之前,使用计算机模拟来识别有希望的化合物
现在,《美国癌症研究学会纳米》的研究人员使用计算机建模来评估四种肽,这些肽模拟了人类蛋白质的病毒结合域,使非典病毒进入细胞
为了感染细胞,SARS-CoV-2利用其尖峰蛋白附着在ACE2受体上,ACE 2受体是某些人类细胞表面的一种蛋白质。
这种附着使病毒与宿主细胞膜融合并进入
许多研究人员一直试图找到阻断尖峰蛋白关键区域的化合物,以防止病毒感染细胞
萧炎·汉和彼得·克拉尔想用计算机建模来设计化合物,以模拟尖峰蛋白的天然靶标——乙酰胆碱酯酶2
为此,研究人员检查了最近发表的SARS-CoV-2受体结合结构域与ACE2结合时的X射线晶体结构。
他们从ACE2中鉴定出15个氨基酸,它们与病毒蛋白直接相互作用。
然后,研究人员设计了四种含有大部分或全部这些氨基酸的抑制剂,并添加了他们认为可以稳定结构的序列
通过计算机模拟,研究小组研究了抑制剂如何附着在体内的尖峰蛋白上,以及结合所需的能量
其中一种化合物显示出与病毒蛋白特别匹配
该小组说,这种肽仍然需要在实验室和患者身上进行测试,但是能够在计算机上缩小候选药物的范围有助于加速这一过程
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