物理科技生物学-PHYICA

酶促光老化研究基因甲PGD-879基化调控

化学 2022-05-17 00:02:10

作者:威利 信用:威利 脱氧核糖核酸上甲基的添加和去除在基因调控中起着重要作用

为了更精确地研究这些机制,一个德国团队开发了一种新方法,通过光照射(光老化),可以阻断特定的甲基化位点,然后在精确的时间解除阻断

据《Angewandte Chemie》杂志报道,所需试剂是通过酶原位生成的

尽管它们看起来非常不同,功能也完全不同,但我们身体中的所有细胞都具有相同的DNA

然而,他们不使用相同的基因

根据细胞的类型和时间的不同,某些基因被开启,而另一些基因被关闭

“开关”是构成脱氧核糖核酸的化学变化

这些变化被称为表观遗传修饰

一个重要的调节机制是甲基化和去甲基化,这意味着甲基(-CH3)的附着和去除

例如,癌细胞的甲基化模式不同于健康细胞

在甲基化过程中,被称为甲基转移酶的酶将甲基从腺苷甲硫氨酸转移到目标分子

为了更密切地研究这种调节的目的和功能并确定甲基化模式,有“工具”来特异性地抑制目标位置的甲基化,然后在规定的时间解除抑制是有用的

为此,安德里亚·伦特梅斯特领导的团队选择了一种称为光老化的方法

在这种方法中,“光老化”是一种在照射下分解的分子,例如2-硝基苄基

笼子首先挡住目标位置,然后用光进行有针对性的照射,起到“开关”的作用,解除封锁

这个想法是给AdoMet类似物配备一个光催化剂,然后转移到甲基化位点

然而,AdoMet类似物在水溶液中分解,不能进入细胞

因此,明斯特大学的团队想在原地生产它们

在体内,腺苷蛋氨酸是由氨基酸蛋氨酸通过蛋氨酸腺苷转移酶(MAT)的作用产生的

腺苷蛋氨酸类似物的合成需要甲硫氨酸与一个相连的硝基苄基光合作用,以及一个可以使用这种改变的底物的氨基甲酸乙酯

从单细胞生物(人隐孢子虫)的MAT酶开始,研究人员能够小心地改变酶中的特定氨基酸,以增加其疏水结合腔的大小,从而使其可以包含硝基苄基。

晶体结构分析表明,该模拟物结合在该光老化膜的空腔中

基于这一信息,研究小组还生产了第二种基于耐热MAT酶的聚碳酸酯MAT,该酶来自日本产甲烷菌

这两种聚碳酸酯甲基转移酶都与脱氧核糖核酸和核糖核酸甲基转移酶相容,并使光聚合酶能够附着在质粒脱氧核糖核酸的所有天然甲基化位点上

光线照射解除了封锁

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