名古屋大学 TRAP显示方法从数万亿个以SARS-CoV-2为目标的蛋白质库中“搜寻”合成蛋白质
这种方法能够鉴定出可用于检测病毒和治疗新冠肺炎病毒感染者的蛋白质
信用:村上博史 由日本名古屋大学科学家领导的一个研究小组开发了一种方法,可以快速找到特定结合重要目标的合成蛋白质,如SARS-CoV-2病毒的成分
这种方法发表在《科学进展》杂志上,可以用来开发测试工具或寻找治疗方法
“我们开发了一种实验室技术,用于快速选择与SARS-CoV-2强结合的合成蛋白质,”名古屋大学生物分子工程师村上博史说
“高亲和力的合成蛋白可用于开发针对SARS-CoV-2的敏感抗原检测,并在未来用作受感染患者的中和抗体
" 村上和他的同事以前开发了一种叫做TRAP展示的蛋白质选择实验室测试,它代表“转录-翻译与嘌呤霉素接头的结合”
“他们的方法跳过了另一种常用的搜索合成蛋白质文库的技术中两个耗时的步骤
但是他们的研究表明嘌呤霉素接头有问题
在目前的研究中,研究小组通过修改嘌呤霉素接头改进了他们的技术
最终,他们能够使用他们的TRAP展示来识别九种合成蛋白质,这些蛋白质与非典病毒外膜上的尖峰蛋白结合
与使用常用的信使核糖核酸显示技术所需的几周时间相比,这种方法只需要四天时间
TRAP展示包括使用大量的DNA模板,这些模板编码并合成数万亿携带随机肽序列的蛋白质
在修饰的嘌呤霉素接头的帮助下,合成蛋白质与脱氧核糖核酸连接,然后暴露于目标蛋白质
当整个样品被清洗后,只有结合到目标上的合成蛋白保留下来
然后将它们放回TRAP显示屏进行下一轮检测,直到只剩下少量非常特异的靶结合合成蛋白
研究人员研究了九种被发现与非典病毒结合的合成蛋白质
一些人能够在新冠肺炎患者的鼻拭子中特异性地检测到非典病毒,这表明他们可以用于检测试剂盒
一种是附着在病毒上,防止它与受体结合,而受体是病毒用来接触人类细胞的
这表明这种蛋白质可以作为一种治疗策略
村上说:“我们的高速、改进的TRAP显示器可能有助于实现对SARS-CoV-2亚种和其他可能导致未来大流行的新病毒的快速反应。”
这项名为“捕捉并中和SARS-CoV-2的抗体样蛋白质”的研究发表在2020年9月18日的《科学进展》在线版上
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