作者:鲍勃·伊尔卡，物理
（同organic）有机 信用:Unsplash/CC0公共领域 加州大学旧金山分校的一对研究人员开发了一种新的蛋白质结构，可以简化定制蛋白质的过程
在他们发表在《科学》杂志上的论文中，尼古拉斯·波利齐和威廉·德格拉多讨论了他们的结构单元以及他们如何使用它
伯明翰大学的安娜·皮科克在同一期杂志上发表了一篇透视文章，概述了加州团队的工作
化学家被要求做的事情之一是为某些特殊应用定制设计蛋白质
研究人员指出，这样做被认为是非常具有挑战性的
它通常需要大量的反复试验，这通常会导致高开发成本
在这项新的努力中，研究人员设计了一种新的蛋白质结构单元来帮助这些项目
他们称之为范德梅尔结构，并描述了如何将其用于直接将配体化学基团功能映射到肽残基骨架坐标
为了想出新的结构，研究小组在蛋白质数据库中翻来翻去，分析了成千上万的蛋白质结构
他们的方法不同于常规方法，因为他们忽略了氨基酸残基侧链的位置，而是关注与残基接触的化学基团
使用这种方法，他们能够设计两种新的蛋白质，用于鉴定一种叫做阿哌沙班的药物
值得注意的是，他们的方法只涉及制作六个序列
在他们工作之前，这样的过程通常需要更多的时间
这种新结构的名字来源于范德瓦尔斯吸引力与旋转体的结合——氨基酸可以采用的侧链构象
新的结构通过将氨基酸的主链映射到蛋白质数据库中与它们相互作用的化学物质的位置来工作
研究人员指出，直到最近，数据库才掌握了足够的信息，可以在这样的应用中使用
他们还指出，该技术和结构也可用于生产基于蛋白质的递送载体以及小分子应用
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