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酶复合体中有组织的混乱柴崎怜花——令人惊讶的见解和新观点

化学 2022-01-20 00:02:13

马克斯·普朗克学会斯蒂芬妮·赖因伯格著 AROM复合物的十种酶成分在起作用,催化背景中描绘的化学反应

信用:马克斯·普朗克学会 对于有助于新陈代谢的蛋白质分子来说,与其代谢途径的其他成分的相互作用至关重要

位于图宾根的马克斯·普朗克发育生物学研究所的科学家们现在已经研究了一种由10种具有五种不同活性的酶组成的天然酶复合体

他们发现,分子结构惊人地紧凑,但为单个酶提供了最大的自由移动空间,这为药物发现开辟了新的前景

科学家们已经在《自然化学生物学》上发表了他们的成果

在教科书中,代谢途径总是看起来有点像流水线作业

一种酶跟随着另一种酶,就像绳子上的珍珠

中间产品从一个工位转移或传递到另一个工位

马克斯·普朗克发育生物学研究所的组长马库斯·哈特曼说:“然而,在细胞中,这种现象通常不会以如此有序的方式发生。”

“代谢途径的各个组成部分可以位于细胞内的不同区域,在大多数情况下,人们不知道它们是否以及如何聚集在一起形成有序结构

" 为了理解代谢途径的功能和动力学,科学家们还研究了单个成分的相互作用和层次结构

这是把握全局的唯一方法

考虑到这一点,哈特曼和他的团队已经研究了一个被充分研究的莽草酸途径

它发生在植物和微生物中,包括病原真菌和寄生原生生物,如引起弓形体病或疟疾的病原体

它的任务之一是合成氨基酸苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的前体,这是动物和人类必需的

该途径最近也作为臭名昭著的除草剂草甘膦的目标而受到关注

图宾根的研究人员指出,虽然莽草酸途径的大多数酶单独存在于植物和细菌细胞中,但在真菌和原生生物中,七种成分中的五种结合在一个叫做AROM的大型酶复合体中

哈特曼说:“我们想知道这个大型综合体是如何构建的,它的架构有什么优势。”

“例如,如果催化作用在这个复合体中更有效

" 科学家们成功地解决了整个蛋白质复合物的晶体结构

他们发现,这五种酶成分,每一种都有两个拷贝,在一个非常小的空间里组装成一个紧凑的结构,总共有10种成分

哈特曼说:“我们没想到会有这么紧凑的建筑。”

“莽草酸途径中的许多酶实际上需要相当大的工作空间

" 然而,由于其巧妙的建筑,AROM建筑群的可用空间是足够的

哈特曼说,尽管晶体结构只代表了复合体的静态快照,“单个组件被研究得如此之好,以至于我们可以在计算机模型中模拟它们如何在复合体中移动

" 事实证明,单个酶所必需的行动自由是经过调整的,这样它们就可以独立运动而不会发生碰撞

该研究的第一作者哈舒尔·阿罗拉·韦拉斯特说:“我们实际上没有证据表明单个酶的运动有任何协调性。”

“这更像是有组织的混乱

" 进一步的研究表明,仅仅是酶的聚集——形成AROM复合物——不足以给真菌和原生生物的莽草酸途径提供催化优势——至少根据目前的数据是这样的

哈特曼说:“实验室条件下的比较表明,复合物的产量并不比分散的单个酶的产量高。”

“对于试图通过酶的聚集来优化催化级联效率的生物技术学家来说,这可能是一个令人惊讶的消息

" 首先,图宾根科学家获得的结果有助于基础研究——深入了解酶,特别是酶复合物在代谢途径中的作用

然而,它们也为药物发现开辟了全新的视角

哈特曼解释说:“在这方面,AROM复合体中特别灵活的酶成分的紧密排列非常有趣。”

在大多数情况下,药物攻击催化中心,即酶进行反应的地方

“对于AROM综合征,可以想象开发出一种药物,其作用类似于酶成分之间的楔子,以阻断它们

“这种方法可能导致只对真菌或原生生物起作用的抑制剂的开发,如引起弓形体病或疟疾的病原体,但不损害植物和细菌的莽草酸途径

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