作者洛里·弗里德曼，利哈伊大学 一种硫蛋白的模型
学分:博士
Yeolkyo Choi/Lehigh SARS冠状病毒2型(SARS-CoV-2)是2019年冠状病毒病(新冠肺炎)的已知病因
“尖峰”或S蛋白促进病毒进入宿主细胞
现在，来自韩国首尔国立大学、英国剑桥大学和美国利哈伊大学的一组研究人员已经合作生产了第一个全长S蛋白的开源全原子模型
研究人员说，这一点特别重要，因为S蛋白在病毒进入细胞中起着核心作用，使其成为疫苗和抗病毒药物开发的主要目标
细节可以在一篇论文中找到，“在病毒膜中开发一个完全糖基化的全长SARS-CoV-2尖峰蛋白模型”，该论文刚刚在《物理化学杂志》上在线发表
这个视频演示说明了如何从他们的SARS-CoV-2 S蛋白模型构建这个膜系统
模型构建程序是开放访问的，可以在CHAMM-GUI的主页上找到，方法是单击新冠肺炎档案链接，或者单击标题中的档案链接，然后单击左侧栏中的新冠肺炎蛋白质链接
由利哈伊大学生物科学系和生物工程系教授Wonpil Im开发的CHAMM-GUI(GUI =图形用户界面)是一个简单、精确和快速地模拟复杂生物分子系统的程序
Im将它描述为一个“计算显微镜”，使科学家能够理解分子水平的相互作用，而这是其他任何方式都无法观察到的
更多关于CHAMM-GUI的信息可以在这个视频中找到
“我们的模型是第一个完全糖基化的全长SARS-CoV-2尖峰蛋白模型，可供其他科学家使用，”Im说。
“我很幸运能和博士合作
来自韩国首尔国立大学的Chaok Seok和博士
美国剑桥大学的特里斯坦·克罗尔
K
我们的团队花了几天几夜，从已知的低温电磁结构部分非常仔细地构建这些模型
建模非常具有挑战性，因为在许多地区，简单的建模无法提供高质量的模型
" 据Im称，科学家可以利用这些模型来进行创新和新颖的模拟研究，以预防和治疗新冠肺炎病
S蛋白结构是用冷冻电镜确定的，RBD号朝上(PDB号:6VSB)，RBD号朝下(PDB号:6VXX)
但是，这个模型有许多缺失的残基
因此，他们首先模拟缺失的氨基酸残基，然后模拟其他缺失的结构域
此外，他们模拟了所有附着在硫蛋白上的潜在聚糖(或碳水化合物)
这些聚糖阻止抗体识别，这使得开发疫苗变得困难
他们还建立了一个S蛋白的病毒膜系统，用于分子动力学模拟
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