物理科技生物学-PHYICA

新的计算机银魂吧建模可以促进药物发现

化学 2022-08-11 00:02:08

贝尔法斯特女王大学 图1

变构调节剂复合物中M2、β2和P2Y1受体的x光结构中GPCR变构结合位点的位置

(A–C)受体与结合的变构调节剂的整体视图

(一)与LY2119620(绿色)结合的M2受体,细胞外侧的PAM结合,和邻位配体Iperoxo(蓝色)

β2受体结合在细胞内侧的不动蛋白-15上

(三)P2Y1受体与结合在脂质界面的一种不动蛋白BPTU的复合物

受体为野生型,具有重建的细胞内短环3 (ICL3)片段

(D–F)变构调节剂和受体之间的结合相互作用,从M2、β2和P2Y1受体的x光受体-配体复合物的分子动力学模拟中获得

形成强相互作用的关键残基和变构配体分别呈灰色和绿色棒状

氢键和π–π相互作用分别用粉色和青色虚线表示

信用:DOI: 10

1021/acscentsci

1c00802 贝尔法斯特女王大学的科学家开发了一种计算机辅助数据工具,可以改善一系列疾病的治疗

计算机建模工具将预测更具选择性的潜在药物的新结合位点,从而实现更有效的药物靶向,提高治疗效果并减少副作用

数据工具或方案将揭示一类新的化合物——G蛋白偶联受体中的变构药物

GPCRs是最大的膜蛋白家族,从激素、神经递质和其他内源性分子传递细胞内信号

由于其对人体生理学的广泛影响,GPCRs是许多治疗领域的药物靶标,如炎症、不孕、代谢和神经障碍、病毒感染和癌症

目前,超过三分之一的药物通过GPCRs发挥作用

尽管在治疗上取得了巨大的成功,但是由于混杂的结合和随后的副作用,GPCR药物的发现是具有挑战性的

最近的研究指出了其他结合位点的存在,这些位点被称为变构位点,药物可以与这些位点结合并提供多种治疗益处

然而,变构位点和药物的发现大多是偶然的

确定原子和分子结构的最近的X射线晶体学,以及提供几种GPCRs的3D模型的低温电子显微术,为开发计算机辅助方法寻找变构位点提供了机会

研究人员开发了一种计算机辅助方案来绘制GPCRs中的变构位点,以期开始变构药物的合理搜索,为一系列疾病的新解决方案和疗法提供了机会

博士;医生

来自皇后大学药学院的资深作者Irina Tikhonova解释说:“我们开发了一种新颖、经济、快速的管道来发现GPCRs变构位点,它克服了目前计算协议的局限性,如膜扭曲和非特异性结合

“我们的管道可以在短时间内识别变构位点,这使得它适合工业环境

因此,我们的管道是一个可行的解决方案,可以启动基于结构的变构药物搜索,寻找对癌症、炎症和中枢神经系统疾病有影响的任何膜结合药物靶点

" 这项发表在《ACS中央科学》上的研究是与贝尔法斯特女王大学和伦敦玛丽女王大学合作的

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