作者:多丽丝·达尔,贝克曼高级科学技术研究所 顶部,高光谱可视化,使用来自标准9小时实验的数据,与高光谱可视化,使用来自建议的1小时实验的数据进行比较
学分:贝克曼高级科学技术研究所 一种新的计算质谱成像方法使研究人员能够实现生物样品的高质量分辨率和高空间分辨率,同时以指数速度提供数据集
贝克曼高级科学技术研究所的研究人员开发了一种子空间质谱成像方法,通过设计基于模型的重建策略,在不牺牲质量的情况下,加快了数据采集的速度
该技术是利用动物模型开发的,可能对许多应用有重要影响,包括分析化学和临床研究,其结果只需几分之一的时间即可获得
它还可以检测各种生物分子——从神经递质和氨基酸等小分子到脂质或肽等大分子
论文“使用子空间方法加速傅里叶变换-离子回旋共振质谱成像”发表在美国质谱学会杂志上
伊利诺伊大学香槟分校生物工程研究生谢宇轩说:“傅里叶变换离子回旋共振是一种非常强大的仪器,能提供最高的质量分辨率。”他是该论文的第一作者
“但ICR金融时报的一个缺点是它非常慢
所以从本质上来说,如果人们想要达到一定的质量分辨率,他们必须等待几天才能获得数据集
我们的计算方法加快了采集过程,可能从一天到一两个小时——基本上是数据采集速度的十倍
" “我们的方法正在改变我们获取数据的方式,”谢说
“该技术不是获取每个像素的质谱,而是识别高维成像数据中的冗余,并使用低维子空间模型来利用这种冗余,仅从数据的子集重建多光谱图像
" 谢与生物工程助理教授范霖、乔纳森五世合作
斯威德勒,詹姆斯·R
艾兹纳家族捐赠的化学讲座和化学科学学院的院长,他们是这篇论文的共同主要研究者
分子和综合生理学研究生丹尼尔·卡斯特罗也有贡献
“我们已经在核磁共振成像和核磁共振波谱成像工作中使用子空间模型很长时间了,”林说
“很高兴看到它在不同的生化成像模式方面也有很大的潜力
" “获得增强的化学信息的能力和化学物质在复杂样本中的位置,如大脑的一部分,成为我们神经化学研究的基础,”斯威德勒说
子空间成像的概念是由电气和计算机工程教授梁志培首创的,他是贝克曼的全职教员,是磁共振成像和MRSI的世界领先专家
随着研究人员寻求将该技术应用于三维成像,研究仍在继续
“(这种方法)对于科学界更大范围的三维成像,比如大脑,可能会有更大的影响,”谢说
“因为如果我们在《金融时报-ICR》上做50个切片,现在可能需要几周时间,但(用这种技术)我们可能在几天内就能获得不错的报道
“我相信计算成像,尤其是数据驱动的方法,就像一颗闪亮的新星
它变得越来越强大,我们肯定应该利用这些技术通过质谱成像对组织进行化学分析
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