物理科技生物学-PHYICA

寡聚脲折叠体模拟肽的α涩谷瞳螺旋,并有效地结合药物靶标

化学 2022-05-27 00:02:12

作者:威利 信用:威利 一些有用的药物由作用于其蛋白质靶标的肽组成

为了使它们更加有效和稳定,科学家们找到了一种用脲基单位取代肽的关键片段的方法

这些寡脲由基于脲的单元组成,折叠成类似于肽的结构

发表在Angewandte Chemie杂志上的这项研究总结说,基于低聚脲的“假”肽增强了合理药物设计的选择

几种药物是抑制或激活某些蛋白质作用的肽

为了提高效率,科学家们正在研究模拟肽

肽模拟物包含类似氨基酸的小有机单位链——肽的构建模块——但与它们不同

其原理是蛋白水解酶不太可能攻击这种假肽链,因此药物会更有效

然而,被称为寡聚体的合成链必须折叠到原始肽的结构中,才能与目标蛋白正确结合

来自CNRS波尔多大学的吉勒·吉沙尔和他的团队,以及来自斯特拉斯堡大学和法国米卢斯尤里克制药公司的同事,已经探索了由脲基单元构成的低聚物,脲基单元是脲的衍生物

这些寡糖折叠成螺旋,这是肽的标志结构之一

然而,有细微的差别

“寡脲螺旋比最初的肽α螺旋每圈残基更少,每圈上升更小,直径更大,”吉沙尔说

为了确定寡脲是否能模拟真实的肽结构,研究人员制备了肽-寡脲杂交体,并研究了它们与靶蛋白的结合

其中一个靶点,MDM2,是肿瘤抑制蛋白p53的天然调节剂

另一种,视黄醇脱氢酶,是调节细胞生长、免疫和其他生物功能所需的蛋白质

对于MDM2结合肽模拟物,研究人员通过用脲基单位替换三个末端关键氨基酸来制备杂交体

对于视黄醇结合肽模拟物,他们用脲基单位取代了中间氨基酸片段

经过几轮优化,作者发现了具有高结合亲和力的杂交结构

结合亲和力与原始肽相似

此外,x光分析显示,混合结构采用规则的螺旋结构

然而,螺旋仍然比天然肽的螺旋稍宽,并且在沿着寡聚脲主链的侧链之间具有更大的空间

肽-寡脲杂交体有望抵抗蛋白水解降解,这是药物化学的一个重要目标

另一个优点是它们允许更多的修改

“α氨基酸可以在两个位置被取代,但是脲基单位多了一个位置,”吉沙尔说

这意味着混合肽-寡聚脲药物提供了更多的优化选择

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