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化学 2022-05-07 00:02:06

马克斯·普朗克学会 在无氧条件下获得的CODH/ACS晶体

棕色来自蛋白质所含的天然金属

学分:马克斯·普朗克海洋微生物研究所

瓦格纳 许多工业部门的废气主要含有一氧化碳和二氧化碳

如今,这些气体被简单地吹入我们的大气层,但这种情况可能很快就会改变

这个想法是利用细菌的力量将有毒的废气转化为有价值的化合物,如乙酸盐或乙醇

这些后来可以用作生物燃料或合成材料的基本化合物

第一批实际规模的试验工厂已经在评估中,在工业规模上使用这种转化,这些过程的明星是吞噬一氧化碳、二氧化碳和二氢的细菌,其中梭状芽孢杆菌是最受欢迎的

马克斯·普朗克海洋微生物研究所微生物新陈代谢小组组长特里斯坦·瓦格纳说:“在这种微生物中,用来进行气体转化的新陈代谢主线得到了表征。”

“但是在分子水平上仍然有很多问号

“不来梅科学家关注的焦点:有毒的一氧化碳是如何被酶以如此惊人的效率处理的? 水晶大惊喜 一氧化碳转化的分子水平知识来源于对高沼虾的研究

这是一种方便且研究充分的海洋模式生物,但与自产乙醇梭菌不同,它对废气的解毒能力较差

这两种细菌使用相同的酶来转化一氧化碳:一氧化碳脱氢酶/乙酰辅酶a合酶,简称CODH/ACS

这是一种非常常见的酶,在地球的原始时代就已经存在

瓦格纳说:“由于两个物种使用相同的酶来转化一氧化碳,我们希望看到完全相同的结构,最终只有微小的差异。”

为了他们的研究,瓦格纳和他的同事奥利弗

勒麦尔正在研究自产乙醇梭状芽孢杆菌,以了解它如何在生命热力学中茁壮成长,使用类似于第一生命形式的新陈代谢

Olivier N

勒麦尔在无氧条件下培养细菌并纯化其CODH/ACS,这对酶是有害的

两位科学家使用结晶法获得了酶CODH/ACS的晶体,并通过x光结晶学确定了蛋白质的三维结构

“当我们看到结果时,我们简直不敢相信自己的眼睛,”瓦格纳说

“来自自产乙醇梭菌的CODH-ACS界面与高沼虾热cetica的模型截然不同,尽管它是相同的酶和相似的细菌

" 图表显示了CODH/ACS复合物的双向性

自动产乙醇菌(橙色的CODH和紫色的ACS)

在化能自养的条件下,这种酶可以将二氧化碳转化为一氧化碳,封存在气体通道(顶部)

一氧化碳将被转化为乙酰辅酶a,这是细胞的组成部分,用于获取细胞能量和构建细胞物质

在气体转化过程中,由工业活动释放的一氧化碳可以被一氧化碳/碳氢化合物系统(底部)非常有效地利用

它被众多的气体通道捕获,并同时产生乙酰辅酶a和化学能,使细胞能够从一氧化碳中获得生命

信用:O

勒梅尔和T

瓦格纳

使用的非版权图像来自美国国家海洋与大气管理局(NOAA)和Pexel照片库(黑吸烟者;美国国家海洋和大气管理局海洋勘探和研究办公室,2016年马里亚纳群岛深水勘探;克里斯·勒布迪利尔的工厂摄影 相同的成分,不同的建筑 之后,两位研究人员进行了进一步的实验,以证明第一个结构不是人工制品,而是生物现实

随后的实验证实了初始模型

因此,这一发现清楚地证明了以前的假设是错误的,即酶CODH/ACS总是具有相同的整体结构

奥利维尔·N解释说:“穆尔勒菌的酶呈线形。”

勒梅尔是这项研究的第一作者,这项研究最近发表在科学杂志《BBA生物能学》上

“在穆尔勒氏嗜热菌中,这种酶在CODH中产生一氧化碳,并用于ACS

在它们之间,它被捕获并通过一个密封的气体通道

ACS最终将合成乙酰辅酶a,一种进一步加工成乙酸盐和乙醇的建筑材料

细胞的其余部分看不到任何一氧化碳

" 但是自产乙醇梭菌直接吸收一氧化碳

“在自产乙醇梭菌中,CODH/ACS酶不仅有一个开口,而且有几个开口

通过这种方式,它可以收集尽可能多的一氧化碳,并将其导入一个双向运行的完整隧道系统,”勒麦尔说

“这些结果表明,在这些细菌的进化过程中,内部气体通道发生了改变,从而形成了一个双向复合体,确保了一氧化碳向能量守恒和一氧化碳同化方向的高通量转化,成为主要的细胞动力装置

“在这个过程的最后,还会产生醋酸盐和乙醇,它们可以用来生产燃料

特里斯坦·瓦格纳说:“我们现在对这种非常高效和强健的酶有了一个大概的了解。”

“但我们的发现只是更进一步

除此之外,这种细菌如何生存并利用一氧化碳来满足其整个细胞的能量需求,仍然是一个悬而未决的问题

我们有一些假设,但我们仍处于开始阶段

为了理解一氧化碳转化为乙酸和乙醇的整个化学过程,需要进一步研究蛋白质

"

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