物理科技生物学-PHYICA

多功能的“化学策略探针”用于基于後藤あずさ活性的蛋白质分析

化学 2021-10-04 00:02:04

通过Erica K

麦克文斯大学麦克文斯大学的Brockmeier从Megan Matthews实验室的新研究描述了一种用于绘制数百种不同的酶网站和蛋白质功能的多功能方法

这些新发现使得各种类别的蛋白质和生物途径能够进行成型,并且特异性的靶向治疗,用于广泛的疾病

学分:Matthews实验室研究人员使用合成的小分子工具,已知作为化学Al探针,具有鉴定特定类型的蛋白质的药物性能以发现潜在的新药物引线

然而,目前可用的技术无法进入具有金属,代谢物或翻译后修改的治疗靶标

现在,来自Megan Matthews和同事实验室的一项研究表明,迄今为止仍然存在的这种疾病目标的新方法是“不可驾拉的

”在ACS中央科学出版并在pu上出现发布的9月封面

Matthews实验室的科学家是多学科和协作的化学生物学家

它们具有合成化学,酶学,细胞生物学和基于质谱的化学蛋白质组学的专业知识,这是常用于表征小分子蛋白质相互作用及其对蛋白质功能的影响

使用这种方法,研究人员可以全局概况和发现与特定探针反应的蛋白质,了解这些蛋白质的作用,并抑制蛋白质的活动通过新的机制

在本研究中,研究人员集中在映射有机肼的化学反应性 - NHNH2,探针,该探针模仿第一型FDA批准的抗抑郁药之一,称为苯脲,使用一种称为基于活性的蛋白质分析(ABPP)的方法

经典ABPP探针靶向单一类型的氨基酸,即亲核,或富含电子的氨基酸,而肼探针旨在捕获酶辅因子和翻译后改性的氨基酸电子亲光或电子差

“”肼通过真正有趣的化学捕获各种真正令人兴奋的目标,因此我们将其作为酶抑制剂发现的发射点,“本金Matthews说本研究的调查员

“我们想问一下这项药毛刺可以进行蛋白质组的所有东西,并且由于质谱,我们可以在将探头部署到探测后

”“两条人体细胞系,他们表明探头与目标反应多种酶类,使用各种辅助因子; Cofactors是不同类型的化学机械,有助于蛋白质的功能

那么,通过将探针标记的位置映射在蛋白质上,科学家们证明了两种反应性,称为直接极性攻击和氧化活化/碎片,依赖于肼的通用性质及其捕获不同类型的电子缺陷的能力

最大的技术挑战之一,邮政编程和第一作者宗涛“汤姆”林,是IDE探测探针与蛋白质的反应,因为它不是易于预测的东西

“”我们的溶液使用同位素肼探针,取代天然丰度氮原子14N,其“重”对手15N

这使我们可以看出与蛋白质反应后肼基团是否丧失,“林说

”之后,我们依赖于计算工作流以匹配肽碎片模式和缩小探针标记部位

这种同位素肼探针和计算搜索的组合使我们能够实现我们的目标

“球队发现,尽管肼是广泛的反应,但它们仍然活跃 - 网站指示并被其他占用Pro的分子阻塞Tein的活跃网站

“因为它们靶向功能化学,它们能够读出许多不同酶类的功能状态

,这非常令人惊叹,因为它接近单探测圣杯能够简化任何缺乏电子缺乏的蛋白质功能,“马修斯表示

”现在,原则上,我们可以为现在是“可脱胶”的蛋白质组中发现的目标中发现的目标进行选择性分子。真正强大而且广泛

“下一步,科学家们将详细阐述和调整这些肼,以探索多元化的亲核试剂是否具有与电子手术相同的容量,以用作辅助弧菌依赖性酶的有效的选择性抑制剂

马修斯补充说,因为这些方法是“疾病不可知论”,有独特的机会研究患者样品和疾病模型中Dyregulated的活动

“总的来说,我们预计肼探针保留古典ABPP探针的所有能力,包括发现抑制剂和抑制剂的发现新的行动机制,“马修斯表示

”在某些情况下,我们希望发现一些新的生物学,呢?

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