Omicron变体刺突蛋白突变的3D可视化
左侧:俯视图
右侧:侧视图
突变用红色表示
它们出现在所有的刺突蛋白上，特别是在受体结合域(RBD)和被称为N末端域的区域(NTD)
学分:巴斯德-费利克斯雷伊学院 2021年11月，首次在南非发现了奥米克龙变异体，此后该变异体已传播到许多国家
预计它将在几周或几个月内成为主导变种
初步流行病学研究表明，奥米克龙变异体比目前占主导地位的病毒(德尔塔变异体)更容易传播
它能够传播给接种过两剂疫苗的人和以前感染过的人
巴斯德研究所和疫苗研究所的科学家与KU Leuven(比利时Leuven)、Orlé地区医院、乔治·蓬皮杜欧洲医院(AP-HP)、Inserm和CNRS合作，研究了Omicron变体对临床实践中用于预防高危人群中严重形式疾病的单克隆抗体的敏感性，以及对以前感染新型冠状病毒病毒或接种过疫苗的人血液中抗体的敏感性
他们将这种敏感性与德尔塔变体进行了比较
科学家们证明，奥米克隆对中和抗体的敏感性远低于达美
然后，科学家们分析了接受过两剂辉瑞或阿斯利康疫苗的人的血液
接种疫苗五个月后，血液中的抗体不再能够中和奥米克龙
在过去12个月内感染新型冠状病毒病毒的个体中也观察到了这种功效的丧失
给以前感染过的个体注射一剂增强剂量的辉瑞疫苗或一剂疫苗，可显著提高抗体水平，足以中和奥米克龙
因此，奥米克龙对目前用于临床实践或两次疫苗接种后获得的抗新型冠状病毒抗体不太敏感
该研究于2021年12月15日在bioRxiv网站上以预印本形式发表，并于2021年12月23日在《自然》杂志上发表 初步流行病学研究表明，奥米克隆变异体比德尔塔变异体更容易传播
奥米克龙变异体的生物学特征仍相对未知
与第一个新型冠状病毒相比，它在刺突蛋白中有超过32个突变，并于2021年11月26日被世卫组织指定为关注的变异体
在南非，奥米克隆变种在几周内取代了其他病毒，导致确诊病例数量急剧增加
不同国家的分析表明，病例倍增时间约为2至4天
奥米克隆已在包括法国在内的数十个国家被发现，并在2021年底成为主导
在欧盟卫生应急准备和反应管理局(HERA)支持的一项新研究中，巴斯德研究所和疫苗研究所的科学家与KU Leuven(比利时Leuven)、orlens地区医院、乔治·蓬皮杜医院(AP-HP)和Inserm合作，研究了Omicron与目前占主导地位的Delta变体相比对抗体的敏感性
该研究的目的是描述治疗性抗体以及以前感染过新型冠状病毒病毒或接种过疫苗的人产生的抗体在中和这种新变种方面的功效
来自库鲁汶的科学家们从一名32岁女性的鼻腔样本中分离出了新型冠状病毒的奥米克隆变种，这名女性在从埃及回来几天后患上了中度新冠肺炎病
分离出的病毒立即被送往巴斯德研究所的科学家那里，治疗性单克隆抗体和来自接种过疫苗或以前接触过新型冠状病毒的人的血清样本被用来研究奥米克龙变异体的敏感性
科学家们对奥米克龙病毒的分离样本进行了快速中和试验，该试验由巴斯德研究所的病毒和免疫部门开发
巴斯德研究所的病毒学家和专家与奥尔良地区医院和乔治·蓬皮杜欧洲医院的团队一起，参与了这项多学科协作努力，分析病毒进化和蛋白质结构
科学家们首先测试了九种用于临床实践或目前处于临床前开发阶段的单克隆抗体
六种抗体失去了所有的抗病毒活性，另外三种抗体对奥米克龙的有效性是对达美乐的3到80倍
抗体Bamlanivimab/Etesevimab(由Lilly开发的组合)、Casirivimab/Imdevimab(由罗氏开发并被称为Ronapreve的组合)和Regdanvimab(由Celtrion开发)对奥米克龙不再有任何抗病毒作用
Tixagevimab/Cilgavimab组合(由阿斯利康研发，名为Evusheld)对奥米克隆的疗效是对达美的80倍
“我们证明了这种高度传播的变异体已经获得了对抗体的显著抗性
目前大多数针对新型冠状病毒的治疗性单克隆抗体都是无效的，”该研究的最后一位作者、巴斯德研究所病毒和免疫部门负责人奥利维尔·施瓦茨评论道
科学家们观察到，之前感染新冠肺炎病毒的患者，在症状出现后12个月采集的血液，以及接种了两剂辉瑞或阿斯利康疫苗的患者，在接种疫苗后5个月采集的血液，几乎没有中和奥米克龙变异体
但是接种疫苗后一个月分析的接受辉瑞加强剂量的个体的血清，对奥米克龙仍然有效
然而，在细胞培养试验中，与德尔塔相比，中和奥米克龙需要5到31倍的抗体
这些结果有助于阐明疫苗在预防严重疾病方面的持续功效
“我们现在需要研究加强剂量的保护时间长度
奥利维耶·施瓦茨解释说:“这些疫苗在预防感染病毒方面可能变得不那么有效，但它们应该继续预防严重的病毒。”
“这项研究表明，Omicron变体阻碍了疫苗和单克隆抗体的有效性，但它也证明了欧洲科学家共同努力确定挑战和潜在解决方案的能力
虽然KU Leuven能够使用比利时基因组监测系统描述欧洲首例Omicron感染病例，但我们与巴黎巴斯德研究所的合作使我们能够以创纪录的时间开展这项研究
仍有大量工作要做，但由于欧盟卫生应急准备和反应管理局(HERA)的支持，我们现在显然已经达到了一个点，来自最好的中心的科学家可以协同工作，并朝着更好地理解和更有效地管理疫情的方向前进，”该研究的最后一位合著者、比利时库鲁汶大学医学教授、国家参考实验室和新冠肺炎基因组监测网络负责人伊曼纽尔·安德雷评论道
科学家们得出结论，奥米克龙变异体刺突蛋白的许多突变使其能够在很大程度上逃避免疫反应
正在进行的研究旨在确定为什么这种变异更容易在个体之间传播，并分析加强剂量的长期效果
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