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尽管有效和安全疫苗的开发和日益广泛的可获得性为新冠肺炎大流行的未来恢复提供了最大的希望，但基因组监测正成为实现有效缓解和遏制的重要必要条件
美国报告的新冠肺炎病例居世界首位，但在病毒变异体的监测和基因组测序方面排名全球第43位
来自佛罗里达大西洋大学施密特医学院的研究人员和合作者在《柳叶刀微生物》杂志上发表了一篇关于基因组监测对抗新冠肺炎的评论
一个多世纪以来，传染病的流行病学监测，或通过系统地收集、整合和传播数据来观察发病率的分布和趋势，一直是疾病控制的金标准
关于新冠肺炎，研究人员表示，在变异体扩散到整个美国之前，基因组监测对于发现表型或抗原不同的变异体同样重要
S
和世界其他地方
“基因组监测利用了下一代测序和系统发育方法的应用，以促进更大的早期预测，并启动有效的策略来缓解和遏制新型冠状病毒变体和其他新型病毒的爆发，”珍妮特·D说
博士
D
，第一作者，高级研究副院长，施密特医学院生物医学科学系主任
“基因组测序有助于识别突变，包括与疫苗效力降低或病毒传播性增加相关的突变
具有共有突变的其他变异体在对治疗的反应方面可能相似，并进一步证明了基因组监测的必要性
" 在评论中，作者解释说，与包括流感在内的其他核糖核酸病毒类似，新型冠状病毒病毒在其基因组中不断积累多态性
随着病毒基因组获得这些核苷酸变化，研究人员可以将创新的基因组分析与更传统的流行病学工具相结合，以允许对关注的新变体进行早期表型和免疫学表征
“除了利用这些变化来识别可能在人群中传播的不同病毒谱系，序列信息的可用性使研究人员能够识别可能改变疾病检测、传染性或严重程度的变体，”Robishaw说
“特别感兴趣的是负责宿主细胞结合和进入的刺突蛋白的变化，这可能导致现有诊断测试中的假阴性
此外，这种变异可能影响传播率、健康结果、治疗反应和疫苗效力
" 研究人员指出，除了基因组检测，还需要类似的全球举措，通过建设全球能力、提供科学和技术专业知识以及支持不发达国家和弱势群体来跟踪病毒感染的演变
他们指出，在全球范围内提高监测和基因组测序的能力将有助于更有效地应对当前的大流行，不仅在影响病毒进入的尖峰区域，而且在影响病毒复制、校对和转录的病毒基因组的其他部分捕获未检测到的新变异
斯科特·M说:“高收入国家在流行病学和基因组学方面的国际合作力度加大，也为低收入国家提供了可以部署缓解和遏制努力的希望。”
阿尔特，M
D
，M
B
A
，通讯作者，施密特医学院急诊医学副教授
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