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1:726吨的全球分布
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苍白球部分基因组
726个部分(> 25%基因组位置)基因组的抽样国家地图
圆圈的大小对应于基因组的总数(分类),颜色对应于国家
使用的国家坐标是国家质心位置,但俄罗斯(使用图瓦共和国的质心)和墨西哥(使用墨西哥城的位置)除外
按雄蕊设计的地图瓦片(CC-BY 3
0),地图数据通过OpenStreetMap (ODbl)
按国家分列的样本时间分布
圆圈的大小表示当年的样本数量
来自巴尔的摩(美国)的三个样本具有不确定的采样日期(1960-1980年),并被设置为1970年,用于绘制b和e中的日期
来源于尼科尔斯-1912分离株传代变异体的基因组或收集日期不确定的基因组未显示在绘制的时间线中(b,e)
c,按国家分列的样本总数
d,对应于每个贸易点协定谱系的国家样本的相对比例(其中每个国家只有一个样本,这显示了它对应的谱系)
样本在时间上的分布
f,按TPA谱系划分的样本总数
信用:DOI: 10
1038/s 14564-021-01000-z 迄今为止最全面的梅毒基因组研究描绘了该疾病最近在世界范围内的死灰复燃
根据发表在《自然微生物学》上的研究,梅毒在全球广泛传播,尤其是在过去20年里
伦敦卫生与热带医学学院(LSHTM)、韦尔科姆·桑格研究所、英国健康安全局的研究人员及其合作者绘制了该疾病最近在世界各地死灰复燃的地图
他们在14个国家发现了几乎相同的梅毒样本,全球梅毒人群由两个谱系组成,SS14和Nichols
对这些谱系的详细分析为梅毒的遗传多样性提供了重要的见解,并对疫苗设计和抗微生物药物的耐药性产生了影响
梅毒是全球最常见的性传播感染之一,每年约有600万人感染
由梅毒螺旋体细菌引起,很容易治疗,尽管症状可能会在个人意识到自己被感染之前消退,或者根本不会出现
如果不治疗,梅毒会导致严重的长期健康问题
怀孕期间发生的梅毒感染会传染给孩子,导致先天性梅毒
这是全球死产的第二个主要原因,对于足月分娩的儿童来说,可能会有严重的发育后果
可以通过怀孕期间的早期筛查和治疗来预防
先天性梅毒在没有此类筛查项目的国家更为常见
在这项由韦尔科姆资助的研究中,LSHTM和韦尔科姆桑格研究所的研究人员协调收集了来自23个国家的726份梅毒样本
这包括美国和西欧等抽样良好的地区,以及中亚、澳大利亚和非洲等抽样较差的地区
桑格研究所对每个样本的基因组进行了测序,并进行了系统发育和聚类分析,以绘制全球梅毒人群图
因为随着时间的推移,DNA的变化以一种已知的和可预测的速度发生,不同序列之间的祖先关系就可以建立起来
研究小组发现,所有的样本都来自两个深深分支的谱系,尼科尔斯和SS14
这两种血统目前都在23个抽样国家中的12个国家流传,其中14个国家的样本几乎相同
博士;医生
这项来自韦尔科姆桑格研究所的研究的第一作者马修·比尔说:“1983年以前感染病人的显性梅毒谱系与今天感染病人的不同
我们的分析表明,人口瓶颈出现在20世纪90年代末,这表明T
苍白,很可能是艾滋病毒/艾滋病危机的结果
从公共卫生的角度来看,令人担忧的是,许多国家几乎相同的样本表明,这种疾病正在定期在国际上传播
梅毒又回来了,而且是全球性的
" 梅毒发病率在1980年代和1990年代有所下降,部分原因是艾滋病毒/艾滋病流行后更安全的性行为
但近几十年来,梅毒再次增加,自2010年以来,在一些国家增加了300%以上
在一些国家,梅毒不成比例地影响男男性行为者——例如,2017年英国90%的梅毒病例发生在男男性行为者中
博士;医生
该论文的资深作者、英国卫生安全局(UKHSA)的Helen Fifer说:“近几十年来梅毒病例的激增非常令人担忧
这是一种很容易不被发现的性传播感染,近年来,很大一部分病例是在男男性行为者(MSM)的潜伏阶段被诊断出来的
由于先天性梅毒的风险,异性恋者中梅毒的增加也令人担忧
任何与新的或临时伴侣发生性行为的人都应该使用避孕套并接受测试——性传播感染会对个人健康以及他们现在或未来的性伴侣的健康造成严重后果
" 这项研究是了解结核分枝杆菌遗传多样性的宝贵资源
这将对疫苗设计和耐药性产生影响
许多测序的样本对大环内酯类抗生素有耐药性,大环内酯类抗生素是一类用于治疗许多性传播感染的抗生素,尽管没有一个样本对最常见的梅毒治疗药物苄星青霉素有耐药性
任何梅毒疫苗都需要针对最常见的t病毒谱系进行定制
目前流通的苍白球
来自LSHTM和韦尔科姆桑格研究所的这项研究的资深作者尼古拉斯·汤姆森教授说:“将这项研究整合在一起是一项巨大的后勤工作,没有我们的国际合作者,我们不可能完成这项研究
我们想建立梅毒基因组学领域,这些数据为未来的研究提供了坚实的基础
结合最近培养T的能力
在实验室里,现在在这个领域有丰富的活动,这是很重要的,因为梅毒正在迅速成为一个紧迫的公共卫生问题
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