地理图揭示了基于中国和欧洲的病毒变种进入西非国家的不同模式(直到2020年4月)
学分:德国杜塞尔多夫海因里希-海涅大学 在新型冠状病毒疫情疫情爆发之初,人们担心疫情会淹没许多非洲国家薄弱的卫生系统
然而,与非洲相比,欧洲和美国的发病率和死亡率要高得多
其原因可能在于相对年轻的人口、以前的病毒感染和温暖的气候
然而,新型冠状病毒影响了所有非洲国家,因此发起了在全球分发疫苗的倡议
在大多数国家,病毒分离株的基因组是连续测序的
可以对DNA序列进行系统发育分析,以确定病毒变异的起源,并监测新变异的发展和分布,新变异可能更温和,或者在最坏的情况下更致命
杜塞尔多夫海因里希-海涅大学的研究人员在对西非国家——冈比亚、加纳、尼日利亚和塞内加尔——的病毒序列进行系统发育分析时,揭示了新型冠状病毒变异的独特模式
教授
博士;医生
詹姆斯·阿德杰是这项发表在《科学报告》上的研究的资深作者
生物信息学家沃斯科·瓦鲁克是这篇论文的第一作者
尽管四个被调查的国家有相似的地理和气候条件,研究人员发现了不同的病毒变异模式
这可能反映了一种被称为“创始人效应”的遗传漂变机制,在这种机制中,遗传多样性仅由形成新的独立群体的一小部分群体驱动,例如将病毒变种从法国传播到塞内加尔的特定感染者
“当你观察病毒变异的不同模式时,你可以直接看到历史关系
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塞内加尔曾是法国的殖民地,与法国的模式相似,因为塞内加尔和法国之间仍有大量的交通和贸易往来
加纳和尼日利亚都是前英国殖民地,病毒模式相似
这两个国家都与欧洲和中国有贸易和劳工联系,”海因里希-海涅杜塞尔多夫大学医学院的加纳-英国教授、干细胞研究和再生医学研究所所长詹姆斯·阿德杰说
Wruck补充道,“令人惊讶的是,我们发现来自欧洲的晚期变异体比早期变异体更早被发现
对此的解释可能是早期的病毒变异体潜伏传播,而后期的变异体由于病毒传播性更高而更早被发现
" 由于新型冠状病毒病毒是一种核糖核酸病毒,当核糖核酸在人体宿主细胞内复制时,就会发生突变
在系统发育分析中,指向相似起源的相似突变模式聚集在一棵树的分支中,如果它们足够大,可以被称为变异
突变可能没有效果,也可能导致氨基酸取代,从而改变病毒蛋白质的功能或结构
教授
Adjaye和他的同事从GISAID数据库下载了来自四个西非国家的新型冠状病毒序列,并以中国、欧洲和美洲的序列作为参考
通过系统发育分析,这些序列可能与病毒变异体相关,此外,每个国家都可以检测到不同类型的病毒变异体
在2020年4月的第一阶段研究中,最突出的氨基酸替代是天冬氨酸(D)被病毒刺突蛋白内614位(D614G)的甘氨酸(G)改变(由RNA突变A23403G引起)
Wruck表示,“我们看到D614G在2020年4月逐渐取代了其他变体
2021年6月,它取代了它们,并被包括在所有新的变体中,如α和δ
2021年10月,delta变体占据主导地位,未来的问题将是delta的哪个子变体将占上风?“delta变体的传播具有进化优势,因为氨基酸替代导致群体内更高的传播
瓦鲁克评论道:“2020年4月,我们只能检测到少数似乎源自西非的罕见突变,2021年6月,出现了源自尼日利亚的埃塔(η)变种。”
Adjaye补充说,“需要对病毒序列进行持续监测,以控制新变种的传播,并评估疫苗效力
然而,对于未来的治疗,更好地理解COVID19的潜在机制也是至关重要的,正如我们在早期的出版物中所做的那样,该出版物阐明了肺细胞中新型冠状病毒感染引起的分子变化
肾脏是第二个受影响最严重的器官,有报道称感染新冠肺炎病毒的成年人出现了急性肾损伤(AKI)和肾功能突然丧失
我们目前正在将实验室生产的刺突蛋白(这是目前疫苗的基础)引入从尿液样本中分离出来的人类肾细胞
这项工作将阐明与细胞因子风暴、细胞损伤和肾损伤相关的基因和药物途径
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