VIB(佛兰德斯生物技术研究所) 无花果
1珠上BS3交联揭示了高度相互关联的复合物
(一)利用TML标记亚基和腺苷脱氨酶1/泛素1标记亚基串联亲和纯化三肽链
纯化的复合物通过在4-20% SDS-PAGE上的银染色进行分析
除了LOLITA,所有的TPC亚单位都是根据质谱(数据文件S8)鉴定的,并在两种凝胶之间显示
m,标记;热休克蛋白70
EF1,伸长系数1;TEV,烟草腐蚀病毒
串联亲和层析——用不同浓度的牛血清白蛋白交联前后纯化的TML-葡萄糖,在4-20%的聚丙烯酰胺凝胶上银染分析
预计分子量为914 kDa的大尺寸的TPC表现为单个亚基的损失和不能穿透堆积凝胶的蛋白质的积累
用Xvis可视化在PSB-D细胞培养物中表达的TML-和AtEH1/Pan1标记亚单位的串联纯化后的交联分析
每个分析源自总共六个实验,并结合了1
2和5毫米BS3数据集
(四)如(三)所示,TWD40-1和TWD40-2之间亚单元间交联的碎裂谱的一个例子
学分:科学进步(2021)
DOI: 10
1126/sciadv
abe7999 细胞依靠膜来保护自己免受外界的伤害
但是细胞膜不能完全封闭,因为营养物质和其他分子必须能够通过
为此,细胞膜有许多类型的通道和孔
此外,细胞膜中还嵌入了受体,持续监测外界环境并向细胞内部发出信号
五个VIB小组之间的广泛合作使人们对植物用来调节其外膜蛋白质组成的机制有了更好的理解
这一发现发表在《科学进展》杂志上,增强了我们对质膜组成如何基于外部刺激而适应的基本知识,而外部刺激是地球上生命的一个基本过程
TPLATE的分子结构 复杂的生命有复杂的细胞,也称为真核细胞
例如,与细菌不同,复杂生命的细胞有许多不同的内部隔间,称为细胞器
这些细胞器相互交换物质
要做到这一点,细胞器有几个技巧,其中之一是囊泡贩运
这意味着他们用自己的一部分薄膜作为袋子来交换货物
最近的一项发现表明,植物在很大程度上依赖于一种叫做TPLATE复合物的蛋白质复合物
这种复合物不仅存在于植物中,而且广泛存在于其他真核生物中,这表明它在进化上是古老的,是蛋白质复合物家族的一部分,所有其他成员都被深入研究
然而,由于这种特殊的复合物并不存在于研究最多的模式生物(动物和酵母)中,它的存在和功能在很长一段时间内一直被忽视
在这项研究中,VIB团队首次揭示了TPLATE的分子结构
他们通过交联质谱和计算机模拟实现了这一点
这些新的见解揭示了这个复合体朝向膜的方向,以及它的亚单位的不同域之间的微妙关系
这些发现对于增加关键真核生物过程的知识很重要
事实上,这种复合体的结构现在允许我们将其与存在于所有真核生物(包括动物和酵母)中的近亲的已知结构进行比较,从而使研究人员能够可视化这些运输复合体的进化
为了获得对这个谜一样的复杂系统的结构和功能的洞察力,需要一种综合的、协作的方法
五个VIB研究小组和一个来自捷克共和国的小组在其专门知识范围内做出了贡献,进行了从脂质结合研究到结构生物学方法的实验
在VIB蛋白质组学核心设备的帮助下,新的结构见解主要是基于交联质谱产生的
“在VIB工作的一个主要好处是,它极大地鼓励和促进了对知识和专业技能的获取,这使得研究团队能够成功地开展远远超出他们舒适范围的联合项目,”教授表示
丹尼尔·范·达姆
这项研究将为进一步的科学工作奠定基础,并为开发新的更安全的除草剂或调节植物的胁迫反应打开大门
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