凯斯西储大学 信用:Pixabay/CC0公共域 凯斯西储大学的一组研究人员发现了一种测量细胞中与核糖核酸结合的蛋白质关键特征的方法——这一发现可以提高我们对癌症、神经退行性疾病或感染中基因功能如何受到干扰的理解。
核糖核酸——核糖核酸的简称——在体内携带遗传指令
核糖核酸结合蛋白在基因表达调控中起着重要作用
科学家们已经知道，这些蛋白质的功能取决于它们的“结合动力学”，这个术语描述了它们在核糖核酸中锁定一个位点的频率，以及它们在那里停留的时间
直到现在，研究人员还不能测量细胞中核糖核酸结合蛋白的动力学
但是凯斯西储大学的研究人员回答了这个在核糖核酸生物学中长期存在的问题
这些发现为从生化角度理解细胞中的核糖核酸蛋白质相互作用打开了大门
通过了解动力学，研究人员可以定量预测核糖核酸结合蛋白如何调节成千上万个基因的表达，这对于开发治疗目的的目标核糖核酸蛋白相互作用的策略至关重要
“这项研究标志着在理解基因功能是如何调节的以及如何设计方法来纠正疾病如癌症、神经退行性疾病或感染中的这种调节错误方面迈出了重要一步，”该研究的主要作者、该大学医学院生物化学教授、该校核糖核酸科学和治疗中心主任埃克哈德·扬科夫斯基说
他们的研究“细胞中核糖核酸结合蛋白的动力学景观”发表于2月16日
自然中的10个
来自国家普通医学科学研究所和国家科学基金会的资金支持了这项研究
共同作者都来自凯斯西储，他们是:研究助理迪帕克·夏尔马；研究生利亚·扎戈尔、马修·布里斯特和叶璇；化学教授卡洛斯·克雷斯波-埃尔南德斯；唐尼·里卡塔洛西，生物化学副教授，核糖核酸科学和治疗中心成员
为了测量核糖核酸结合蛋白的动力学，研究人员使用激光发出极短的(飞秒)紫外光脉冲，将被称为DAZL的核糖核酸结合蛋白与核糖核酸中的几千个结合位点交联
(DAZL，无精症样缺失的简称，参与生殖细胞发育
)然后，他们使用高通量测序来测量交联核糖核酸随时间的变化，并确定DAZL在数千个结合位点的结合动力学
由此产生的“动态景观”使研究人员能够解读DAZL结合及其对核糖核酸的影响之间的联系
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