物理科技生物学-PHYICA

鲤鱼基因组揭示了鱼类的物种形成和染色体进矢口七海化

生物 2022-08-15 00:03:11

中国科学院刘佳 鲤鱼跳出水面

信用:IHB 在《分子生态资源》网上发表的一项研究中,由教授领导的研究小组

中国科学院水生生物研究所(IHB)的何顺平及其合作者揭示了东亚鲤科鱼类的进化史,并进一步探讨了鲢鱼和鳙鱼的进化和物种形成,以及种群间的基因组分化

何教授的团队通过整合短阅读测序和遗传图谱,为鲢和鳙鱼提供了高质量和连续性的染色体水平基因组组合

他们对20条鲢鱼(7条来自珠江,4条来自阿穆尔河,9条来自长江)和22条鳙鱼(8条来自珠江,4条来自阿穆尔河,10条来自长江)进行了重新测序,并发现在9

200万年后,这个分支从包含鲤鱼和金线鲃的分支中分化出来

结果表明,由于两条祖先染色体的融合,东亚鲤科鱼类可能只有24对染色体

此外,通过系统发育分析,研究人员发现鳙鱼与鲢鱼形成一个分支,估计分歧时间为3

600万年前

群体遗传学和渐渗研究表明,鲢和鳙鱼有很大的差异,但在群体分析中发现了这两种鱼之间的渐渗现象

然后他们确定了可能与分化或物种形成相关的区域

结果表明,与不同区域相关的基因与生殖系统发育和女性主要性特征的发育有关;不同的区域可能影响两个物种之间的早期物种形成、生殖隔离和环境适应

“这些基因组数据是进一步研究这些东亚鲤科鱼类的进化、保护和商业繁殖的重要资源,”杨教授说

他是团队成员

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