伊利诺伊大学香槟分校 信用:CC0公共领域 研究人员使用单分子成像来比较基因组编辑工具CRISPR-Cas9和TALEN
他们的实验表明,在基因组中被称为异染色质的密集部分,TALEN的效率比CRISPR-Cas9高五倍
脆性X综合征、镰状细胞贫血、β-地中海贫血和其他疾病是异染色质遗传缺陷的结果
研究人员在《自然通讯》杂志上报道了他们的发现
领导这项新研究的伊利诺伊大学香槟分校化学和生物分子工程教授赵慧敏说,这项研究进一步证明,需要更广泛的基因组编辑工具来针对基因组的所有部分
“CRISPR是一个非常强大的工具,它导致了基因工程的一场革命,”赵说
“但它仍有一些局限性
" CRISPR是一种检测入侵病毒的细菌分子
它可以携带几种酶中的一种,如Cas-9,这种酶使它能够在特定的位点切割病毒基因组
塔伦还扫描脱氧核糖核酸来寻找和定位特定的基因
CRISPR和TALEN都可以被改造成针对特定基因来对抗疾病、改善作物特性或用于其他应用
赵和他的同事用单分子荧光显微镜直接观察了这两种基因组编辑工具在活的哺乳动物细胞中的表现
荧光标签使研究人员能够测量CRISPR和TALEN沿着DNA移动以及检测和切割目标位点需要多长时间
赵说:“我们发现CRISPR在基因组中不太紧密的区域工作得更好,但是TALEN比CRISPR能更好地访问异染色质区域的基因。”
“我们还看到,TALEN可以拥有比CRISPR更高的编辑效率
它可以切割脱氧核糖核酸,然后比CRISPR更有效地进行改变
" 在多个实验中,TALEN的效率是CRISPR的五倍
赵说,这些发现将导致针对基因组不同部分的改进方法
“要么我们可以在某些应用中使用TALEN,要么我们可以尝试让CRISPR在异染色质中更好地工作,”他说
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